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九台晚李PGIP基因的克隆及生物信息学分析
引用本文:郭庆勋,张春雨,王晶莹,周连霞,王彦涛.九台晚李PGIP基因的克隆及生物信息学分析[J].植物遗传资源学报,2010,11(5):650-653.
作者姓名:郭庆勋  张春雨  王晶莹  周连霞  王彦涛
作者单位:吉林大学植物科学学院,长春,130062
基金项目:吉林大学农学部博士启动基金项目(430505010203); 长春市科技局国际合作计划项目(2D5070046202)
摘    要:以九台晚李叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列设计引物,PCR扩增到1条全长1192bp的目的片段(GenBank登录号:GU068978)。该基因包含有1个完整的开放阅读框,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长990bp,编码330个氨基酸,其编码的氨基酸序列中含有一段典型的亮氨酸重复序列。序列分析表明:该基因与中国李、杏、桃、马哈利樱桃、梅等李属植物的PGIP基因序列一致度达95%~99%。系统进化分析显示出属内亲缘关系较近、属间亲缘关系较远的特点。该序列为植物分子抗病育种提供了1条新的基因资源。

关 键 词:九台晚李  PGIP基因  基因克隆  生物信息学  

Cloning and Bioinformatic Analysis of PGIP Gene from Jiutaiwanli
GUO Qing-xun,ZHANG Chun-yu,WANG Jing-ying,ZHOU Lan-xia,WANG Yan-tao.Cloning and Bioinformatic Analysis of PGIP Gene from Jiutaiwanli[J].Journal of Plant Genetic Resources,2010,11(5):650-653.
Authors:GUO Qing-xun  ZHANG Chun-yu  WANG Jing-ying  ZHOU Lan-xia  WANG Yan-tao
Institution:GUO Qing-xun,ZHANG Chun-yu,WANG Jing-ying,ZHOU Lan-xia,WANG Yan-tao(College of Plant Science,Jilin University,Changchun,130062)
Abstract:A target fragment with a full length of 1192 bp(GenBank accession:GU068978) was amplified with genomic DNA of Prunus salicina L.cv.Jiutaiwanli leaves as the templates and the conservative sequences of PGIP gene as the primers.This sequence had a full open reading frame encoding the polygalacturonase-inhibiting protein,and eontained two exons interrupted by one intron.The total exons were comprised by 990bp of deoxynucleotide encoding 330 amino acid.A conserved leucine-rich fragmenthad existed in the derived...
Keywords:Prunus salicina L  cv  Jiutaiwanli  PGIP gene  Gene cloning  Bioinformatic Analysis  
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