| 白及MSI1基因的序列分析及SSR多态性分析 |
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| 作者姓名： | 黄恻隐 赵永彬 陈荣辉 李林 闻伟锷 徐德林 |
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| 作者单位： | 1.遵义医科大学 细胞生物学教研室， 贵州 遵义 563099;2.遵义医科大学 珠海校区，广东 珠海 519041 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31560079；31960074）；贵州省科学技术基金项目（黔科合平台人才［2017］5733-050，黔科合平台人才［2017］5712）；贵州省中医药管理局课题（QZYY-2019-060） |
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| 摘 要： | 通过对白及（Bletilla striata （Thunb.） Rchb.f.）的IRA1多拷贝抑制子（multicopy suppressor of IRA1，MSI1）基因序列进行生物信息学分析，并根据其核苷酸序列设计简单重复序列（simple sequence repeats， SSR）引物，进一步验证其在多个白及地方种中高度的保守性。运用Protparam、SOPMA、SWISS-MODEL等生物信息学软件分析白及MSI1蛋白的理化性质和结构域；DNAMAN、MEGA软件分别进行氨基酸多序列比对与系统进化分析；分析序列中的SSR位点并对多个白及品系进行PAGE检测和验证。结果显示，克隆得到的BSMSI1基因全长为3 700 bp，共编码了601个氨基酸残基，预测蛋白质分子量为65 309.75 kg/moL，等电点为5.95，表现出高度的保守性，而且发现不同地区的白及BSMSI1基因在遗传上具有多样性。本研究拓展了对 BSMSI1序列的认识，新开发标记能有效应用于MSI1基因的检测和育种鉴定，同时也可为其他物种的MSI1基因研究提供参考。
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| 关 键 词： | 白及 MSI1基因 结构与功能 生物信息学分析 简单重复序列 |
| 收稿时间： | 2021/3/1 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/4/8 0:00:00 |
Sequence analysis and SSR polymorphism analysis of MSI1 gene in Bletilla striata |
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| Authors: | HUANG Ceyin ZHAO Yongbin CHEN Ronghui LI Lin WEN Weie XU Delin |
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