基于细菌共现网络的土壤粘细菌分离

粘细菌是一类分布广泛的捕食性细菌，能够产生种类多样、结构新颖、作用机制独特的天然活性物质。但是粘细菌分离纯化困难且耗时，导致其资源匮乏，这已成为粘细菌开发利用的重要瓶颈之一。基于辅助菌的分离方法是当前获得粘细菌资源的重要方法，然而辅助菌多为大肠杆菌（Escherichia coli）等革兰氏阴性菌。为了获得新的辅助菌和粘细菌资源，本研究基于土壤细菌16S rRNA基因高通量测序数据构建细菌共现网络（bacterial co-occurrence network），发现粘细菌-细菌子网络中有27%的连接节点为放线菌。因此，本研究选择革兰氏阳性菌球形节杆菌（Arthrobacter globiformis） GDMCC 1.1730作为辅助菌，并在捕食培养基上验证其捕食活性。结果表明该辅助菌能够被所有参与测试的粘细菌（12个物种）所捕食。以GDMCC 1.1730作为辅助菌进行粘细菌的分离，共诱导出11种粘细菌子实体，且包括一种仅由GDMCC 1.1730诱导而大肠杆菌未能诱导出的子实体。本研究基于细菌共现网络和捕食活性验证，提供了一株革兰氏阳性菌作为新的粘细菌辅助菌，该辅助菌能够诱导出土壤中的多种粘细菌子实体，为根据细菌共现网络获取未/难培养微生物资源提供了新的证据。

Isolation of soil myxobacteria based on bacterial co-occurrence network