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培养基灭菌方式对细菌分离效率的影响
作者姓名:
刘阳
裴韬
杜娟
邓名荣
朱红惠
作者单位:
广东省微生物研究所 华南应用微生物国家重点实验室/广东省菌种保藏与应用重点实验室,广东 广州 510070
基金项目:
广东省重点领域研发计划(2018B020205003);广东省省级科技计划项目(2019B030316017)
摘 要:
自然界蕴含大量未/难培养微生物,分离这些微生物对理论研究和资源开发具有重要意义。本研究使用高压灭菌和过滤除菌方式制备培养基,采用稀释涂布方法,从红树林灰泥样品中分离获得123株细菌,通过16S rRNA基因序列分析对其进行鉴定,进而探究培养基灭菌方式对细菌分离效果的影响。结果表明:过滤除菌培养基生长的单菌落数目(339±82)个显著多于高压灭菌培养基生长的单菌落数目(179±65)个;两种培养基分离细菌的群落结构在门、科和属分类水平上总体相似,但优势类群的数目和少数类群存在差异;过滤除菌培养基分离细菌的Shannon Wiener’s指数、均匀度、新种率、基因多样性均高于高压灭菌培养基,而其与近缘模式菌株相似度的平均值和中位数则低于高压灭菌培养基。因此,过滤除菌培养基分离获得细菌的多样性、均匀性和新颖性均高于高压灭菌培养基。本研究首次探究培养基灭菌方式对细菌分离效果的影响,具有更高分离效率的过滤除菌培养基为未/难培养微生物菌株资源获取提供了借鉴。
关 键 词:
过滤除菌
高压灭菌
16S
rRNA基因
分离效率
收稿时间:
2020/7/21 0:00:00
修稿时间:
2020/8/14 0:00:00
Effect of the medium sterilization on bacterial isolation efficiency
Authors:
LIU Yang
PEI Tao
DU Juan
DENG Mingrong
ZHU Honghui
Abstract:
Keywords:
filter sterilization
autoclave sterilization
16S rRNA gene
isolation efficiency
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