| Tm-shift基因分型方法在遗传学中的应用 |
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| 引用本文： | 袁芳,徐进,季林丹,费丽娟,刘盼盼,张莉娜.Tm-shift基因分型方法在遗传学中的应用[J].遗传,2012(11):1500-1506. |
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| 作者姓名： | 袁芳 徐进 季林丹 费丽娟 刘盼盼 张莉娜 |
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| 作者单位： | 宁波大学医学院;中国科学院昆明动物研究所-香港中文大学生物资源与疾病分子机理联合实验室 |
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| 基金项目： | 浙江省自然科学基金项目(编号:(Y2100857);浙江省教育厅重点科研项目(编号:Z201017918);宁波市自然科学基金项目(编号:2012A610237,2011A610037)资助 |
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| 摘 要： | Melting Temperature shift(Tm-shift)是一种新的基因分型方法,主要通过在两条特异性引物5′端加入不同长度的GC序列,PCR扩增后根据熔解曲线中产物Tm值的差异来完成分型。文章建立了Tm-shift法对2 048份样品的29个SNP进行分型,通过分型成功率、重复检测一致率、测序验证准确度综合评价分型效果。结果显示,29个SNP中有27个可以采用本方法分型,分型成功率为93.1%。测序验证准确性达到100%。3种基因型阳性标准对照重复检测一致率为100%;100个随机样品重复检测,重复性为97%。因此,Tm-shift基因分型法是一种成本低廉、准确灵敏、稳定可靠、通量灵活、操作简便的基因分型方法,可在遗传学研究中推广应用。
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| 关 键 词： | Tm-shift 基因分型 遗传学 |
Application of Tm-shift genotyping method in genetic studies |
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| YUAN Fang,XU Jin,JI Lin-Dan,FEI Li-Juan,LIU Pan-Pan,ZHANG Li-Na.Application of Tm-shift genotyping method in genetic studies[J].Hereditas,2012(11):1500-1506. |
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| Authors: | YUAN Fang XU Jin JI Lin-Dan FEI Li-Juan LIU Pan-Pan ZHANG Li-Na |
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| Institution: | 1.Department of Preventive Medicine,School of Medicine,Ningbo University,Ningbo 315211,China; 2.KIZ-CUHK Joint Laboratory of Bioresources and Molecular Research of Common Diseases,Kunming 650223,China |
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