| 家蚕光泽小眼(varnished eye)突变基因的精细定位 |
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| 引用本文： | 刘春,李琼艳,荀利杰,胡文波,吕金风,刘茹凤,夏庆友.家蚕光泽小眼(varnished eye)突变基因的精细定位[J].遗传,2014(10). |
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| 作者姓名： | 刘春 李琼艳 荀利杰 胡文波 吕金风 刘茹凤 夏庆友 |
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| 作者单位： | 家蚕基因组生物学国家重点实验室，农业部蚕桑重点实验室，西南大学，重庆 400715 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)项目，教育部“新世纪优秀人才支持计划”项目，国家自然科学基金面上项目 |
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| 摘 要： | 家蚕(Bombyx mori)光泽小眼(varnished eye,ve)突变体是家蚕突变品种中少数关于家蚕复眼形态异常的自然隐性突变品种之一,表现为成虫复眼小,表面富有光泽,有瘤状突起;小眼数量少且不规则。经典遗传学连锁图谱将ve基因定位在第6连锁群32.2座位,但到目前为止,该突变性状的形成机理仍不清楚。文章以突变品种ve和对照品种Dz为亲本,杂交产生的F1代雄个体与轮回亲本ve雌个体回交产生的BC1代为材料进行ve基因的精细定位。通过对ve低密度连锁图谱分析发现,ve基因被定位在SNP3~SNP6之间,物理图谱距离大约为1.2 Mb。利用1563个BC1代个体构建ve高密度连锁图谱,最终将ve基因定位在SNP5~SNP61之间,物理图谱距离大约为221.8 kb。通过家蚕基因数据库对ve最终定位区域内进行预测基因检索,发现有6个预测基因。对6个预测基因进行生物信息学分析和测序,这些候选基因都有可能参与家蚕复眼形成,但在编码区没有发现ve特异的突变位点;对这些候选基因进行表达分析,发现编号为BGIBMGA013642的候选基因在ve复眼形成过程中的表达量明显比正常对照Dz低,推测该基因为最佳候选基因。
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| 关 键 词： | 家蚕 光泽小眼 SNP标记 精细定位 候选基因 |
Fine mapping of the mutant genevarnished eye in the silkworm |
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| Chun Liu,Qiongyan Li,Lijie Xun,Wenbo Hu,Jinfeng Lv,Rufeng Liu,Qingyou Xia.Fine mapping of the mutant genevarnished eye in the silkworm[J].Hereditas,2014(10). |
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| Authors: | Chun Liu Qiongyan Li Lijie Xun Wenbo Hu Jinfeng Lv Rufeng Liu Qingyou Xia |
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| Keywords: | silkworm (Bombyx mori) varnished eye SNP marker fine mapping candidate genes |
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