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双壳纲动物核糖体RNA 185-ITS1序列及其在分子系统发育研究中的应用
引用本文:丁小雷,何毛贤,邓凤姣,张锡元.双壳纲动物核糖体RNA 185-ITS1序列及其在分子系统发育研究中的应用[J].遗传,2004(3).
作者姓名:丁小雷  何毛贤  邓凤姣  张锡元
作者单位:武汉大学生命科学学院动物发育与遗传实验室,中国科学院南海海洋研究所,武汉大学生命科学学院动物发育与遗传实验室,武汉大学生命科学学院动物发育与遗传实验室 武汉 430072,广州 510301,武汉 430072,武汉 430072
基金项目:国家自然科学基金(30150005),国家高技术研究发展计划(863)(批准号:2002AA603022)~~
摘    要:测定了双壳纲不同科、属、种及种内共11个个体的核糖体RNA 18S-ITS1序列。结果表明,该序列在种间存在很高的多态性,长度从558bp到784bp不等,碱基差异百分比在10.7%~61.7%之间,ITS1序列同源性很低,有片段的插入与缺失。种间18S部分序列碱基差异百分比在0.9%~23.7%之间,变化主要是碱基的转换。用邻接法(NJ)构建了8个种的18S部分序列(约240bp)的系统发育树,与传统形态学分类结果相符。马氏珠母贝(Pinctada martensi)4个不同地域个体间的序列差异百分比在0.6%~1.9%之间。分析指出:18S基因可以作为双壳纲动物高阶元系统发育的分子标记;ITS1序列种间变化很大,可以应用于该纲物种的分类及鉴别,在亲缘关系相近种及种内变异相对较小,但核苷酸变异位点信息量丰富,可用于属内种间、亚种和群体间的遗传多样性研究。

关 键 词:ITS1  18S  RNA  遗传多样性  双壳纲

18S-ITS1 Sequence of rRNA in Bivalves and Its Application in Phylogenetic Analysis
DING Xiao-Lei,HE Mao-Xian,DENG Feng-Jiao,ZHANG Xi-Yuan Lab of Animal Development and Genetic,College of Life Science,Wuhan University,Wuhan ,China South China Sea Institute of Oceanology,Chinese Academy of Sciences,Guangzhou . China.18S-ITS1 Sequence of rRNA in Bivalves and Its Application in Phylogenetic Analysis[J].Hereditas,2004(3).
Authors:DING Xiao-Lei  HE Mao-Xian  DENG Feng-Jiao  ZHANG Xi-Yuan Lab of Animal Development and Genetic  College of Life Science  Wuhan University  Wuhan  China South China Sea Institute of Oceanology  Chinese Academy of Sciences  Guangzhou China
Institution:DING Xiao-Lei,HE Mao-Xian,DENG Feng-Jiao,ZHANG Xi-Yuan Lab of Animal Development and Genetic,College of Life Science,Wuhan University,Wuhan 430072,China South China Sea Institute of Oceanology,Chinese Academy of Sciences,Guangzhou 510301. China
Abstract:
Keywords:185 RNA  ITS1  genetic diversity  Bivalves
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