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日本七鳃鳗(Lampetra japonica)Lyb基因的克隆与分析
引用本文:金萍,张玮玮,黄惠芳,马飞.日本七鳃鳗(Lampetra japonica)Lyb基因的克隆与分析[J].遗传,2008,30(12):1597-1602.
作者姓名:金萍  张玮玮  黄惠芳  马飞
作者单位:1. 辽宁师范大学海洋生物功能基因与蛋白质组学研究所,大连,116029
2. 山西生物应用职业技术学院,太原,030001
基金项目:国家自然科学基金,教育部科学技术研究重点项目 
摘    要:摘要: 采用RT-PCR和RACE技术, 从日本七鳃鳗(Lampetra japonica)口腔腺、肝脏中分离获得了3条Y-box基因序列, 分别命名为Lyb1、Lyb2和Lyb3, 生物信息学分析其编码的蛋白质序列长度分别为331、181和171个氨基酸残基。采用DNAMAN软件, 将七鳃鳗的3个Y-box蛋白氨基酸序列与海鞘、斑马鱼、清鳉、河豚鱼和小鼠Y-box蛋白进行同源性分析, 结果显示他们共有一个保守的冷休克结构域, 其中包含两个RNA结合基序RNP-1和RNP-2, 表明获得的Lyb基因属于Y-box 基因家族成员。此外, 从Swiss-Prot下载了经实验验证过的Y-box蛋白序列数据, 结合实验克隆得到的Lyb基因所编码的氨基酸序列构建系统发育树, 发现Y-box基因在有颌类出现以前只有一种类型, 有颌类出现以后, Y-box基因分化成YB1、YB2和CSDA三种类型。

关 键 词:日本七鳃鳗  Y-box基因  cDNA末端快速扩增(RACE)  序列分析  系统发育分析
收稿时间:2008-04-28
修稿时间:2008-07-13

Cloning and analysis of Lyb gene from Lampetra japonica
JIN Ping,ZHANG Wei-Wei,HUANG Hui-Fang,MA Fei.Cloning and analysis of Lyb gene from Lampetra japonica[J].Hereditas,2008,30(12):1597-1602.
Authors:JIN Ping  ZHANG Wei-Wei  HUANG Hui-Fang  MA Fei
Institution:1. Institute of Functional Gene & Proteomics of Marine Biology Liaoning Normal University, Dalian 116029, China;
2. Shanxi Biological Application Vocational Technical College, Taiyuan 030001, China
Abstract:
Keywords:
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