| GSDS: 基因结构显示系统 |
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| 引用本文： | 郭安源,朱其慧,陈新,罗静初.GSDS: 基因结构显示系统[J].遗传,2007,29(8):1023-1026. |
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| 作者姓名： | 郭安源 朱其慧 陈新 罗静初 |
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| 作者单位： | 北京大学生物信息中心,北京大学蛋白质工程和植物基因工程重点实验室,北京大学生命科学学院,北京,100871 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划)，高等学校博士学科点专项科研项目，国家高技术研究发展计划(863计划)，国家科技大平台项目 |
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| 摘 要： | 构建了一个用于绘制基因结构示意图的网站系统(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)。用户可提交核酸序列、NCBI核酸序列号或基因外显子位置信息, 得到基因结构示意图; 并可指定在基因结构图上标注某些特定区域。系统允许用户同时输入多个基因, 并指定输出次序和标注区域。结果可用位图和矢量图两种图形格式显示。点击位图格式结果, 可以查看相应序列。系统提供中英文两种用户界面。
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| 关 键 词： | 基因结构示意图 生物信息网络工具 计算机图形 |
| 文章编号： | 10.1360/yc-007-1023 |
| 收稿时间： | 2006-12-09 |
| 修稿时间： | 2006-12-09 |
GSDS: a gene structure display server |
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| GUO An-Yuan,ZHU Qi-Hui,CHEN Xin,LUO Jing-Chu.GSDS: a gene structure display server[J].Hereditas,2007,29(8):1023-1026. |
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| Authors: | GUO An-Yuan ZHU Qi-Hui CHEN Xin LUO Jing-Chu |
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| Institution: | Center for Bioinformatics, Peking University, Beijing 100871, China |
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| Abstract: | We developed a web server GSDS (Gene Structure Display Server) for drawing gene structure schematic diagrams. Users can submit three types of data:CDS and genomic sequences,NCBI GenBank accession numbers or GIs,exon positions on a gene. GSDS uses this information to obtain the gene structure and draw diagram for it. Users can also designate some special regions to mark on the gene structure diagram. The output result will be PNG or SVG format picture. The corresponding sequence will be shown in a new window by clicking the picture in PNG format. A Chinese version for the main page is also built. The GSDS is available on http://gsds.cbi.pku.edu.cn/. |
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| Keywords: | gene structure display bioinformatics web tool computer graphics |
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