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水稻基因组上一个Ds切离及其双位点插入行为的分子鉴定
引用本文:赵丁丁,乔中英,程孝,王建平,焦翠翠,孙丙耀.水稻基因组上一个Ds切离及其双位点插入行为的分子鉴定[J].遗传,2014(12).
作者姓名:赵丁丁  乔中英  程孝  王建平  焦翠翠  孙丙耀
作者单位:1. 苏州大学基础医学与生物科学学院,苏州,215123
2. 苏州市农业科学院作物研究室,苏州,215155
基金项目:苏州市应用基础研究计划项目
摘    要:玉米转座元件Ac/Ds是hAT转座子家族的成员,导入水稻基因组后具有转座活性,尽管转座机制还不完全清楚,但它们通常经保守的非复制型“剪切-粘贴”过程转座。研究表明,在Ac编码的转座酶作用下, Ds从原位点切离后常优先重新插入到连锁位点。文章利用 TAIL-PCR技术从水稻一个 Ds插入突变体及其回复突变体中分离Ds侧翼序列,结合生物信息学分析方法,对Ds在突变体上插入位点、回复突变体内切离足迹和重新插入位点进行了分子鉴定。结果显示,突变体中Ds从3号染色体切离后,在原插入位点残留了8 bp足迹序列(CATCATGA),引起Ds标记基因外显子和内含子数目增加,从而影响基因结构。切离后的Ds重新插入回复突变体第2和第6号染色体上,分别编码烟草胺氨基转移酶和衰老相关蛋白的2个基因的编码区。因此,典型的“剪切-粘贴”机制不能完全解释Ds的转座行为, Ds转座存在“剪切-复制-粘贴”的特点。

关 键 词:水稻  Ds元件  侧翼序列  切离足迹  转座

Molecular identification of one event of Ds excision and re-insertion at two loci in rice genome
Dingding Zhao,Zhongying Qiao,Xiao Cheng,Jianping Wang,Cuicui Jiao,Bingyao Sun.Molecular identification of one event of Ds excision and re-insertion at two loci in rice genome[J].Hereditas,2014(12).
Authors:Dingding Zhao  Zhongying Qiao  Xiao Cheng  Jianping Wang  Cuicui Jiao  Bingyao Sun
Abstract:
Keywords:Oryza sativa L    Ds element  flanking sequence  excision footprint  transposition
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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