| 京海黄鸡体重性状全基因组关联分析 |
| |
| 引用本文： | 张涛,王文浩,张跟喜,王金玉,薛倩,顾玉萍.京海黄鸡体重性状全基因组关联分析[J].遗传,2015(8). |
| |
| 作者姓名： | 张涛 王文浩 张跟喜 王金玉 薛倩 顾玉萍 |
| |
| 作者单位： | 1. 扬州大学动物科学与技术学院，扬州 225009; 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室，扬州 225009
2. 江苏京海集团,南通,226103 |
| |
| 基金项目： | 国家肉鸡产业技术体系项目，江苏高校优势学科建设工程项目和江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室项目资助 |
| |
| 摘 要： | 体重性状是肉鸡重要的经济性状。为了寻找可用于京海黄鸡体重性状遗传改良的分子标记及候选基因,本文以400只京海黄鸡核心群母鸡为基础,测定了0~14周龄体重,利用简化基因组测序技术(Specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq)对京海黄鸡体重性状进行全基因组关联研究(Genome-wide association stndy,GWAS),筛选与京海黄鸡体重性状相关的SNPs位点。结果共检测到100个与京海黄鸡体重相关的SNPs位点,其中15个位点效应达到全基因组显著水平(P1.87E-06),85个位点效应达到全基因组潜在显著水平(P3.73E-05)。通过筛选每个显著SNP周围1 Mb区域内的基因,共找到9个可能的候选基因,其中FAM124A(Family with sequence similarity 124A)、QDPR(Quinoid dihydropteridine reductase)、WDR1(WD repeat domain 1)和SLC2A9(Solute carrier family 2(facilitated glucose transporter),member 9)4个基因可能是影响体重性状的重要候选基因。同时还发现,4号染色体75.6~80.7 Mb区域集中了大部分与京海黄鸡中后期体重性状显著相关的SNPs位点,该区域可能是影响京海黄鸡中后期生长体重的重要候选区域。
|
| 关 键 词： | 京海黄鸡 全基因组关联分析 体重性状 简化基因组测序 |
A genome-wide association study on body weight traits of Jinghai yellow chicken |
| |
| Tao Zhang,Wenhao Wang,Genxi Zhang,Jinyu Wang,Qian Xue,Yuping Gu.A genome-wide association study on body weight traits of Jinghai yellow chicken[J].Hereditas,2015(8). |
| |
| Authors: | Tao Zhang Wenhao Wang Genxi Zhang Jinyu Wang Qian Xue Yuping Gu |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Jinghai yellow chicken GWAS body weight traits SLAF-seq |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
|
