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| 中国部分地方鸡种MHC B-G基因第二外显子的遗传多态性 | |
| 引用本文： | 徐日福,李奎,陈国宏,强巴央宗,张玉波,林丽,樊斌,刘榜.中国部分地方鸡种MHC B-G基因第二外显子的遗传多态性[J].动物学报,2006,52(1):160-169. |
| 作者姓名： | 徐日福 李奎 陈国宏 强巴央宗 张玉波 林丽 樊斌 刘榜 |
| 作者单位： | 1. 华中农业大学动物科技学院,武汉,430070;吉林农业大学动物科技学院,长春,130118 2. 华中农业大学动物科技学院,武汉,430070 3. 扬州大学动物科技系,江苏,扬州,225009 4. 西藏大学农牧学院畜牧兽医系,西藏,林芝,860000 |
| 基金项目： | 引进国际先进农业科学技术项目“948”(No.2001361)，国家重点基础研究发展规划项目(No.G2000016103)~~ |
| 摘 要： | 根据鸡主要组织相容性复合体BG基因序列设计特异性引物,在9个中国地方鸡种和1个国外引进鸡种基因组中扩增了包括其第一内含子和第二外显子在内、长度为401bp的DNA片段。经PCRSSCP分型筛选后,对该片段的核苷酸序列进行克隆测序和直接PCR测序及比对分析,发现了31个MHCBG新等位基因;各等位基因主型所含有的亚型数及其在不同品种间的分布极不均衡。第二外显子核苷酸序列和其所编码的MHCBG抗原类IgV结构域氨基酸序列比较表明,在中国地方鸡种BG基因第二外显子的207bp序列中有37个多态性变异位点,其中简约性信息位点29个,单个位点的变异8个;等位基因间的遗传变异范围0.0013-0.1433;各变异位点的核苷酸变异指数0.206-1.462。该编码区核苷酸的异义替换率为9.26%±1.92%,高于同义替换率2.34%±0.90%。所估计的核苷酸转换数和颠换数随着遗传距离的增加而逐渐增加,当核苷酸转换数和颠换数达到平衡后,该片段核苷酸转换数的增加幅度逐渐高于颠换数。在其所编码的类IgV结构域氨基酸序列中,多态变异位点有22个,其中简约性信息位点6个,单变异位点16个;所估测的等电点为8.45,疏水性氨基酸占40.3%,亲水性氨基酸占29.9%;该序列具有明显的疏水性特点。等位基因间的系统发生分析表明,31个BG等位基因分为两个群,相同主型的等位基因首先聚类。本研究为鸡BG基因的免疫功能和遗传进化研究提供了分子依据 |
| 关 键 词： | 中国地方鸡种 B-G基因 等位基因 遗传多态性 |
| 收稿时间： | 2005-09-05 |
| 修稿时间： | 2005-09-052005-10-28 |
Genetic polymorphism within exon 2 of MHC B-G gene in nine Chinese indigenous chicken breeds |
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| XU Ri-Fu,LI Kui,CHEN Guo-Hong,QIANGBA Yang-Zong,ZHANG Yu-Bo,LIN Li,FAN Bin,LIU Bang.Genetic polymorphism within exon 2 of MHC B-G gene in nine Chinese indigenous chicken breeds[J].Acta Zoologica Sinica,2006,52(1):160-169. | |
| Authors: | XU Ri-Fu LI Kui CHEN Guo-Hong QIANGBA Yang-Zong ZHANG Yu-Bo LIN Li FAN Bin LIU Bang |
| Abstract: | |
| Keywords: | Chinese indigenous chicken B-G gene Allele Genetic polymorphism |
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