| 日本牙鲆主要组织相容性复合体DAB等位基因的多态性 |
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| 引用本文： | 徐田军,陈松林,田永胜.日本牙鲆主要组织相容性复合体DAB等位基因的多态性[J].动物学报,2008,54(5). |
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| 作者姓名： | 徐田军 陈松林 田永胜 |
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| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室,山东青岛,266071;上海海洋大学生命科学与技术学院,上海,200090
2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室,山东青岛,266071 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划)，国家自然科学基金，国家高技术研究发展计划(863计划)，山东省泰山学者工程项目 |
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| 摘 要： | 根据牙鲆(Paralichthys olivaceus)主要组织相容性复合体(MHC)DAB基因序列设计特异性引物,在日本牙鲆基因组中扩增了包括DAB基因完整外显子2和内含子1在内的长度为408 bp的DNA片段.对该片段克隆测序后,发现了37个MHC-DAB等位基因,各等位基因的频次以及各主型中亚型数目分布都不平衡.在第二外显子273 bp核苷酸序列中有50个位点发生变异,核苷酸多样性PI值为0.0618,在编码的氨基酸序列中存在多态变异位点30个,其中简约信息位点29个,单变异位点1个.非同义替代与同义替代的比率在抗原结合区(PBR)和非PBR编码区分别为10.0和1.62,分析表明正向选择机制可能是产生牙鲆MHC-DAB多态性的主要因素.估计的核苷酸的转换和颠换数随着遗传距离的增加而增加.各等位基因间的系统发生关系表明,19个主型分为两个群.对氨基酸组分和密码子的偏倚性以及分布频率的分析表明各同义密码子的使用频率不均衡.本研究为牙鲆MHC-DAB基因的遗传进化和分子标记辅助育种的研究提供了理论基础.
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| 关 键 词： | 牙鲆 主要组织相容性复合体 等位基因 多态性 |
MHC-DAB allele polymorphism in Japanese flounders Paralichthys olivaceus |
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| XU Tian-Jun,CHEN Song-Lin,TIAN Yong-Sheng.MHC-DAB allele polymorphism in Japanese flounders Paralichthys olivaceus[J].Acta Zoologica Sinica,2008,54(5). |
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| Authors: | XU Tian-Jun CHEN Song-Lin TIAN Yong-Sheng |
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| Institution: | XU Tian-Jun1,2,CHEN Song-Lin1,TIAN Yong-Sheng11.Key Lab for Sustainable Utilization of Marine Fisheries Resources of the Ministry of Agriculture,Yellow Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Qingdao 266071,Sh,ong,China2.College of Aqua-life Science , Technology,Shanghai Ocean University,Shanghai 200090,China |
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| Abstract: | Polymorphism of the major histocompatibility complex(MHC)DAB gene in Japanese flounder Paralichthys olivaceus was investigated using sequences analysis.In this study,24 individuals were selected to amplify partial exon1 and intron2,complete intron1 and exon2 of DAB gene.131 sequences were subsequently used to analyze genetic variation and revealed 31 different sequences,which presented 31 novel alleles belonging to 19 allele major types according to accepted nomenclature rules.Frequency of alleles and numbe... |
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| Keywords: | Japanese flounder Paralichthys olivaceus Major histocompatibility complex Allele Polymophism |
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