Streptomyces bacillaris ATCC15855T中bafilomycin A1合成基因簇的挖掘 |
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引用本文: | 赵守静,高坤鹏,刘振,毛相朝.Streptomyces bacillaris ATCC15855T中bafilomycin A1合成基因簇的挖掘[J].工业微生物,2019,49(6). |
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作者姓名: | 赵守静 高坤鹏 刘振 毛相朝 |
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作者单位: | 中国海洋大学食品科学与工程学院,青岛266003;中国海洋大学食品科学与工程学院,青岛266003;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋药物与生物制品功能实验室,青岛266237 |
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摘 要: | Bafilomycin A1是大环内酯类抗生素,具有广泛的抗癌活性。通过HPLC及HPLC-MS分析Streptomyces bacillaris ATCC 15855~T的发酵产物,结果显示S.bacillaris ATCC 15855~T发酵能够产生bafilomycin A1。S.bacillaris ATCC 15855~T分离自中亚土壤。通过全基因组测序,获得了S.bacillaris ATCC 15855~T的完整基因组序列。该基因组由6 957 417 bp的线性染色体组成,GC含量为72.29%。该染色体预测了7 284个开放阅读框架(ORF),18个rRNA操纵子,64个tRNA基因。通过antiSMASH v 4.0.3分析,共预测了39个生物合成基因簇。其中,具有抑制液泡型H(+)ATP酶的bafilomycin A1基因簇与已报道的基因簇相似度为100%。在bafilomycin A1合成基因簇中有19个ORFs。
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关 键 词: | Streptomyces bacillaris ATCC 15855T 全基因组序列 Bafilomycin A1 次级代谢产物 基因簇 |
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