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| 一个鼻咽癌相关EST的鉴定及其全长cDNA序列分析 | |
| 引用本文： | 关勇军,贺修胜,候德富,余艳辉,欧阳咏梅,肖志强,陈主初.一个鼻咽癌相关EST的鉴定及其全长cDNA序列分析[J].生命科学研究,2006,10(2):172-177. |
| 作者姓名： | 关勇军 贺修胜 候德富 余艳辉 欧阳咏梅 肖志强 陈主初 |
| 作者单位： | 1. 中南大学,湘雅医学院,肿瘤研究所,中国,湖南,长沙,410078 2. 中南大学,湘雅医院,卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室,中国,湖南,长沙,410078 3. 中南大学,湘雅医学院,肿瘤研究所,中国,湖南,长沙,41007;中南大学,湘雅医院,卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室,中国,湖南,长沙,410078 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(39970287，30000188) |
| 摘 要： | 鼻咽癌是我国南方及东南亚地区常见的恶性肿瘤之一.通过对鼻咽癌染色体高频率杂合性丢失区域3p21的表达序列标签(expressedsequencetag,EST)进行同源性比较分析,运用逆转录聚合酶链式反应的方法,筛选到一个在41.18%(14/34)的鼻咽癌活检组织及20.0%(1/5)的鼻咽癌细胞系中表达下调的ESTBG772301;并用Northern杂交方法,检测了该EST在多种正常成人组织中的表达状况及其所代表基因的转录本大小.在此基础上,对该EST来源的cDNA克隆(IMAGE:4839190)进行直接测序,获得了一个全长为2377bp的新cDNA序列;经生物信息学分析,发现它与已知基因序列无明显同源性,属于一个新基因,定位于染色体3p21.3,被命名为鼻咽癌表达下调基因(NPCEDRG,GenBank登录号:AF538150).其编码的蛋白质含169个氨基酸,与一个已报道的在进化上相对保守、功能未知的人类蛋白Nicolin1(简称NICN1)N端170个氨基酸残基的序列同源性为97%,但缺少NICN1蛋白C端43个氨基酸残基,可能是nicolin1基因不同剪接本的编码产物. |
| 关 键 词： | 鼻咽癌 表达序列标签 全长cDNA 序列分析 |
| 文章编号： | 1007-7847(2006)02-0172-06 |
| 收稿时间： | 2006-02-25 |
| 修稿时间： | 2006-05-15 |
Identification of a Nasopharyngeal Carcinoma-related EST and Sequence Analysis of its Full-length cDNA |
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| GUAN Yong-jun,HE Xiu-sheng,HOU De-fu,YU Yan-hui,OUYANG Yong-mei,XIAO Zhi-qiang,CHEN Zhu-chu.Identification of a Nasopharyngeal Carcinoma-related EST and Sequence Analysis of its Full-length cDNA[J].Life Science Research,2006,10(2):172-177. | |
| Authors: | GUAN Yong-jun HE Xiu-sheng HOU De-fu YU Yan-hui OUYANG Yong-mei XIAO Zhi-qiang CHEN Zhu-chu |
| Institution: | 1, Cancer Research Institute, Xiangya School of Medicine, Central South University, Changsha 410078, Hunan, China; 2. Cancer Research Institute, Ministry of Health Affiliated Key Laboratory of Cancer Proteomics, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha 410078, Hunan, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | nasopharyngeaI carcinoma(NPC) expressed sequence tag(EST) full-length cDNA sequence analysis |
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