| 一种新的非翻译区剪接位点识别方法 |
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| 引用本文： | 吕俊杰,王科俊,冯伟兴,王鑫.一种新的非翻译区剪接位点识别方法[J].生命科学研究,2012,16(1):20-24. |
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| 作者姓名： | 吕俊杰 王科俊 冯伟兴 王鑫 |
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| 作者单位： | 1. 哈尔滨工程大学自动化学院,中国黑龙江哈尔滨,150001
2. 剑桥大学癌症分子研究中心,英国剑桥CB2 1TN |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，国家"863"高科技资助项目，中央高校基本科研业务费专项资金资助项目 |
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| 摘 要： | 为提高非翻译区剪接位点识别的精度,提出一种统计概率与支持向量机相结合的识别方法 .该方法主要分为两个阶段,第一阶段应用统计学方法对非翻译区(UTR)序列进行描述,将序列中各碱基之间的相关性、位置特异性、保守性等特征用概率形式描述,以概率参数作为第二阶段支持向量机的输入向量,第二阶段应用带有多项式核函数的支持向量机(SVM)对剪接位点进行识别.通过对人类5′UTR剪接位点数据集进行测试,结果表明:该方法对非翻译区剪接位点的识别取得了很好的效果.
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| 关 键 词： | 剪接位点 非翻译区 剪接序列 |
A New Method for Identification of UTR Splicing Site |
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| Lü Jun-jie
,
WANG Ke-jun
,
FENG Wei-xing
,
WANG Xin.A New Method for Identification of UTR Splicing Site[J].Life Science Research,2012,16(1):20-24. |
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| Authors: | Lü Jun-jie WANG Ke-jun FENG Wei-xing WANG Xin |
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| Institution: | 1.College of Automation,Harbin Engineering University,Harbin 150001,Heilongjiang,China; 2.Cancer Research Center,University of Cambridge,Cambridge CB2 1TN,U.K.) |
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