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茶陵野生稻冷响应基因OrCr3的克隆及其生物信息学分析
引用本文:刘伟,龚曼,陈淑媛,梁杰婧,徐孟亮.茶陵野生稻冷响应基因OrCr3的克隆及其生物信息学分析[J].生命科学研究,2013,17(3):205-210,261.
作者姓名:刘伟  龚曼  陈淑媛  梁杰婧  徐孟亮
作者单位:湖南师范大学生命科学学院,中国湖南长沙,410081
基金项目:湖南省科技计划重点项目,湖南省教育厅重点科研项目,湖南省自然科学基金资助项目,湖南省生态学重点学科建设项目
摘    要:OrCr3(Oryza rufipogon cold responsive gene 3)是一个从茶陵野生稻中发现的受低温诱导表达的基因.以茶陵野生稻为材料克隆了其cDNA及其启动子区域序列,生物信息学分析表明,该基因的完整ORF(open reading frame)长为1 110 bp,推测编码一个由369个氨基酸残基组成的山梨糖醇脱氢酶蛋白,理论相对分子质量为39.3 kD,pI值为6.03;山梨糖醇脱氢酶具有催化山梨糖醇向果糖转变的作用;对OrCr3的启动子区域进行分析,发现多种可能与逆境应答相关的顺式作用调控元件;该基因编码的蛋白在不同物种中存在高度相似性.以上结果说明OrCr3基因可能是一个保守的耐逆相关基因.

关 键 词:普通野生稻  基因克隆  逆境  生物信息学分析

Cloning and in silico Analysis of a Cold Responsive Gene OrCr3 in Chaling Wild Rice (Oryza rufipogon Griff)
LIU Wei , GONG Man , CHEN Shu-yuan , LIANG Jie-jing , XU Meng-liang.Cloning and in silico Analysis of a Cold Responsive Gene OrCr3 in Chaling Wild Rice (Oryza rufipogon Griff)[J].Life Science Research,2013,17(3):205-210,261.
Authors:LIU Wei  GONG Man  CHEN Shu-yuan  LIANG Jie-jing  XU Meng-liang
Institution:(College of Life Sciences,Hunan Normal University,Changsha 410081,Hunan,China)
Abstract:
Keywords:Oryza rufipogon Griff    gene cloning  stress  in silico analysis
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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