| 直系同源基因的识别方法与数据库 |
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| 引用本文： | 杨婧,黄原,汪晓阳.直系同源基因的识别方法与数据库[J].生命科学研究,2013,17(3):274-277. |
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| 作者姓名： | 杨婧 黄原 汪晓阳 |
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| 作者单位： | 陕西师范大学生命科学学院,中国陕西西安,710062 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目 |
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| 摘 要： | 直系同源(orthology)是指由于物种形成事件而享有共同祖先的基因之间的关系,直系同源基因之间通常具有相似的结构和生物学功能.由于基因组和转录组序列的快速积累,精确的识别直系同源基因有助于功能基因的注释,比较和进化基因组学研究.综述了现有的识别直系同源基因的主要方法,并列举了由此构建的数据库.这些方法可以归纳为三大类,第一类是基于序列相似性的方法,具有识别速度快以及灵敏度高等优点;第二类是基于构建系统发育树的方法,具有准确性高和信息量大等优点;第三类是将上述两种方法结合起来的混合方法,更好地平衡了灵敏性和准确性.最后总结了识别过程所面临的问题.
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| 关 键 词： | 直系同源 直系同源识别 数据库 |
Methods and Databases for Identification of Orthologs |
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| YANG Jing
,
HUANG Yuan
,
WANG Xiao-yang.Methods and Databases for Identification of Orthologs[J].Life Science Research,2013,17(3):274-277. |
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| Authors: | YANG Jing HUANG Yuan WANG Xiao-yang |
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| Institution: | (College of Life Sciences,Shaanxi Normal University,Xi′an 710062,Shaanxi,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | orthology ortholog identification database |
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