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胡子鲇Dmrt1基因全长cDNA克隆及其表达分析
引用本文:邓思平,王静杰,吴天利,朱春华,李广丽.胡子鲇Dmrt1基因全长cDNA克隆及其表达分析[J].水生生物学报,2012(4):610-617.
作者姓名:邓思平  王静杰  吴天利  朱春华  李广丽
作者单位:广东海洋大学水产学院;广东海洋大学,南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室
基金项目:广西科学研究与技术开发计划重点项目(桂科合1140009-4)资助
摘    要:以胡子鲇(Clarias fuscus)为研究对象,利用RT-PCR技术和SMART RACE技术克隆获得Dmrt1基因cDNA全长,并利用生物信息学分析其结构及功能;利用半定量RT-PCR技术检测胡子鲇性腺(精巢/卵巢)、肌肉、肠、肝脏、心脏、头肾、鳃丝、脑和眼等10种组织以及Ⅱ—Ⅴ期精巢中Dmrt1基因表达。结果表明:胡子鲇Dmrt1基因cDNA全长为1417 bp,其中5′非编码区(5′-UTR)为35 bp,3′非编码区(3′-UTR)为516 bp,开放阅读框(ORF)包含864 bp,编码287个氨基酸(aa),预测所编码DMRT1为主要位于细胞核内的不稳定性亲水蛋白。氨基酸序列比对显示,胡子鲇DMRT1与已公布的非洲胡子鲇、蟾胡子鲇、黄颡鱼等鲇形目鱼类的相似性为83.3%—96.1%。胡子鲇DMRT1中具有DMRT基因家族共有的、保守性很高的DM结构域,此结构域具有典型的"C2H2C4"锌指结构,与上述鲇形目鱼类的相似性达100%,与斑马鱼、青鳉、虹鳟等鱼类的相似性为91.9%—97.3%,而与鸡、鼠、猪人等的相似性达80%以上。组织表达显示,胡子鲇Dmrt1基因仅在精巢中表达,且Ⅱ期精巢(即精子发生期)中Dmrt1基因表达量显著高于Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ期精巢(P<0.05),而卵巢及其他8种组织中均无表达,表明Dmrt1是胡子鲇精巢特异性表达基因,可能与胡子鲇的雄性性别决定、精子发生及精巢发育密切相关。

关 键 词:胡子鲇  Dmrt1  DM结构域  精子发生  表达分析

cDNA CLONING AND EXPRESSION ANALYSIS OF Dmrt1 IN CLARIAS FUSCUS
DENG Si-Ping,WANG Jing-Jie,WU Tian-Li,ZHU Chun-Hua,and LI Guang-Li.cDNA CLONING AND EXPRESSION ANALYSIS OF Dmrt1 IN CLARIAS FUSCUS[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2012(4):610-617.
Authors:DENG Si-Ping  WANG Jing-Jie  WU Tian-Li  ZHU Chun-Hua  and LI Guang-Li
Institution:1,2(1.Fisheries College,Guangdong Ocean University,Zhanjiang 524025,China;2.Key Laboratory of Aquaculture in South China Sea for Aquatic Economic Animal of Guangdong Higher Education Institutes,Guangdong Ocean University,Zhanjiang 524025,China)
Abstract:
Keywords:Clarias fuscus  Dmrt1  DM domain  Spermatogenesis  Expression analysis
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