| 荧光定量PCR与LAMP检测IHHNV的特异性和灵敏性比较 |
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| 引用本文： | 赵哲,任春华,江晓,张吕平,冯娟,胡超群.荧光定量PCR与LAMP检测IHHNV的特异性和灵敏性比较[J].水生生物学报,2010,34(5). |
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| 作者姓名： | 赵哲 任春华 江晓 张吕平 冯娟 胡超群 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院南海海洋研究所,海洋生物资源可持续利用重点实验室,广州510301
2. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300 |
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| 基金项目： | 公益性行业(农业)科研专项，国家虾现代产业技术体系，农业部海水养殖生态与质量控制重点开放实验室课题(200881208) |
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| 摘 要： | 传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖对虾的重要病毒性病原之一,给对虾养殖业造成严重经济损失.研究建立了检测IHHNV的荧光定量PCR和环介导等温核酸扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)两种技术,并对它们的特异性和灵敏性进行了比较.结果显示,所建立的荧光定量PCR检测IHHNV的方法最低检测限度为6个DNA拷贝/反应,在待扩增DNA浓度为6.038×104-6.038×109cps/mL,范围时,模板浓度与循环阈值Ct之间的相关性良好,决定系数r2为0.99521;对5份白斑综合症病毒基因组DNA和10份健康对虾基因组DNA样品进行荧光定量PCR检测,结果都为阴性;这说明荧光定量PCR检测IHHNV方法具有灵敏度高、特异性高和精确性高等优点.同样,所建立的LAMP检测IHHNV的方法在60min反应时间内也可榆测到最低为6个拷贝的DNA模板,反应产物加入荧光染料SYBR Green Ⅰ后反应液呈现明显的亮绿色,且特异的检测IHHNV DNA模板;这说明所建立的LAMP检测IHHNV的方法具有荧光定量PCR方法相当的灵敏度、特异性和精确性.考虑到LAMP检测方法操作更为简单、方便,而且不需要昂贵的仪器,LAMP检测IHHNV的方法更适合于对虾养殖现场检测的推广使用.
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| 关 键 词： | 荧光定量PCR 特异性 灵敏度 |
COMPARATIVE STUDY OF SPECIFICITY AND SENSITIVITY FOR IHHNV DETECTION BETWEEN REAL-TIME PCR AND LAMP METHODS |
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| ZHAO Zhe,REN Chun-Hua,JIANG Xiao,ZHANG L-Ping,FENG Juan,HU Chao-Qun.COMPARATIVE STUDY OF SPECIFICITY AND SENSITIVITY FOR IHHNV DETECTION BETWEEN REAL-TIME PCR AND LAMP METHODS[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2010,34(5). |
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| Authors: | ZHAO Zhe REN Chun-Hua JIANG Xiao ZHANG L-Ping FENG Juan HU Chao-Qun |
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| Institution: | ZHAO Zhe,REN Chun-Hua,JIANG Xiao,ZHANG L(u)-Ping,FENG Juan,HU Chao-Qun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | LAMP IHHNV |
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