| 基于16S rDNA和COⅠ基因序列探讨四种溞类的系统关系和分类地位 |
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| 引用本文： | 徐敏,张海军,邓道贵,王文平,张晓莉,查岭生.基于16S rDNA和COⅠ基因序列探讨四种溞类的系统关系和分类地位[J].水生生物学报,2014(6). |
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| 作者姓名： | 徐敏 张海军 邓道贵 王文平 张晓莉 查岭生 |
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| 作者单位： | 淮北师范大学生命科学学院，资源植物生物学安徽省重点实验室，淮北 235000 |
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| 摘 要： | 为了检验已记录的4个溞属种类(隆线溞Daphnia carinata、透明溞D.hyalina、蚤状溞D.pulex和大型溞D.magna)的系统分类,用试剂盒法分别提取4种溞类的基因组DNA。利用特异性引物,通过PCR扩增了4种溞属种类的16S rDNA和COⅠ基因部分序列,并与来自GenBank中每个种类相似度较高的同种序列进行分析。结果表明,基于16S rDNA和COⅠ基因,4个溞属种类的平均种间相似度分别为85.56%和80.67%,碱基中A+T含量均明显高于G+C含量。基于COⅠ基因,巢湖隆线溞与来自GenBank上的拟同形溞(Daphnia similoides AB549199)相似度为99%,分歧度为0.4%—0.9%。就16S rDNA和COⅠ基因而言,巢湖透明溞更接近于盔形溞(Daphnia galeata)。基于16S rDNA和COⅠ基因构建的NJ树和贝叶斯树,两者的主要分枝基本一致。结果暗示,巢湖隆线溞与拟同形溞为一个种,透明溞应属于盔形溞。由于缺乏核基因的研究,有关巢湖溞属的分类地位还需进行更深入的探讨。
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| 关 键 词： | 溞属 16S rRNA COⅠ基因 系统分类 |
PHYLOGENETIC RELATIONSHIP AND TAXONOMIC STATUS OF FOUR DAPHNIA SPECIES BASED ON 16S rDNA AND COⅠSEQUENCE |
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| XU Min,ZHANG Hai-Jun,DENG Dao-Gui,WANG Wen-Ping,ZHANG Xiao-Li,ZHA Ling-Sheng.PHYLOGENETIC RELATIONSHIP AND TAXONOMIC STATUS OF FOUR DAPHNIA SPECIES BASED ON 16S rDNA AND COⅠSEQUENCE[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2014(6). |
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| Authors: | XU Min ZHANG Hai-Jun DENG Dao-Gui WANG Wen-Ping ZHANG Xiao-Li ZHA Ling-Sheng |
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| Keywords: | Daphnia 16S rDNA COⅠgene Systematic classification |
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