| 池蝶蚌致雄性化基因fem-1c及其蛋白分子的结构特征分析 |
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| 引用本文： | 熊文芳,史建伍,蒋谋炎,陈永玲,彭扣,盛军庆,王军花,洪一江.池蝶蚌致雄性化基因fem-1c及其蛋白分子的结构特征分析[J].水生生物学报,2014(6). |
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| 作者姓名： | 熊文芳 史建伍 蒋谋炎 陈永玲 彭扣 盛军庆 王军花 洪一江 |
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| 作者单位： | 南昌大学生命科学与食品工程学院,南昌,330031 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，江西省科技落地计划，江西省科技支撑计划项目，江西省自然科学基金，江西省教育厅科技项目 |
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| 摘 要： | 研究首次获得淡水珍珠贝池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)的致雄性化基因feminization-1C亚型,即fem-1c基因,并进行全长克隆及序列分析。从转录组中Race-PCR扩增fem-1c基因全长cDNA序列,用生物信息学方法对fem-1c基因进行基因组结构分析、多序列同源性比较、跨膜区段、亲疏水性分析、功能结构域预测等。研究结果如下:该cDNA序列全长2328 bp,包含一个1869 bp的最大开放阅读框,编码622个氨基酸,经同源比对和进化树分析,fem-1基因c亚型编码的氨基酸与太平洋牡蛎的同源性最高,为79%;疏水性分析显示该蛋白为亲水性蛋白;二级结构预测发现该蛋白有大量的α螺旋和随机卷曲,形成9个锚蛋白重复序列(Ankyrin repeat,ANK),同时,三级结构预测中可以清楚的看到9个ANK模体,跟SMART预测的结构位点结果相近。从无脊椎动物到脊椎动物fem-1c基因的保守性表明它们有共同的起源,暗示这个基因家族在功能上具备保守性,推测池蝶蚌fem-1c基因可能具备与线虫fem-1基因在性别决定方面上相似的功能。
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| 关 键 词： | 池蝶蚌 fem-1c基因 克隆 序列分析 结构预测 |
STRUCTURE CHARACTERISTICS OF A MASCULINIZED FEM-1C GENE AND ITS PROTEIN FROM HYRIOPSIS SCHLEGELII |
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| XIONG Wen-Fang,SHI Jian-Wu,JIANG Mou-Yan,CHEN Yong-Ling,PENG Kou,SHENG Jun-Qing,WANG Jun-Hua,HONG Yi-Jiang.STRUCTURE CHARACTERISTICS OF A MASCULINIZED FEM-1C GENE AND ITS PROTEIN FROM HYRIOPSIS SCHLEGELII[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2014(6). |
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| Authors: | XIONG Wen-Fang SHI Jian-Wu JIANG Mou-Yan CHEN Yong-Ling PENG Kou SHENG Jun-Qing WANG Jun-Hua HONG Yi-Jiang |
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| Keywords: | Hyriopsis schlegelii fem-1c gene Clone Sequence analysis Structure Prediction |
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