| 鲤鱼多态性EST标记的筛选与特性分析 |
| |
| 引用本文： | 王春艳,俞小牧,童金苟.鲤鱼多态性EST标记的筛选与特性分析[J].水生生物学报,2008,12(2):1-212. |
| |
| 作者姓名： | 王春艳 俞小牧 童金苟 |
| |
| 作者单位： | 1. 中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072;中国科学院研究生院,北京100049
2. 中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072 |
| |
| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划)
,
湖北省创新研究群体科学基金
,
国家自然科学基金 |
| |
| 摘 要： | 表达序列标签(Expressed sequence tag,EST)标记在基因组作图和分子标记辅助育种研究中具有重要价值.筛选和开发可用于遗传作图的鲤鱼多态性EST标记,对研究鲤鱼的基因组结构、遗传多样性研究和遗传育种有重要意义.本研究根据GenBank数据库中鲤鱼EST序列设计了67对EST引物,有47对在鲤鱼基因组DNA中成功扩增得到稳定的特异性条带,经单链构象多态性(SSCP)分析,12对(25.5%)引物扩增的EST在1个鲤鱼回交家系中具有多态性,其中6个为鲤鱼功能基因,5个与斑马鱼(Danio rerio)功能基因具较高相似性,1个与斑点叉尾(Ictalurus punctatus)功能基因具较高相似性.这些多态性的EST在鲤鱼二倍体家系和单倍体群体中的等位基因分离均符合孟德尔规律(1∶1或3∶1),单倍体中的SSCP条带数目为二倍体的二分之一.选用其中4对多态性的EST引物对洞庭湖鲤鱼进行初步群体遗传分析,结果显示基因多样性(H)为0.437,远低于微卫星标记所揭示的该群体基因多样性(接近于1).结果表明,多态性的EST-SSCP标记尽管遗传变异性较低,但是作为来源于编码区的Ⅰ型遗传标记,在遗传作图和种群遗传适应性等研究中有较好的应用潜力.
|
| 关 键 词： | 鲤鱼 EST标记 遗传图谱 单链构象多态性(SSCP) 鲤鱼 多态性 筛选 特性分析 COMMON CARP MARKERS CHARACTERIZATION 应用 遗传适应性 遗传标记 编码区 来源 遗传变异性 微卫星标记 基因多样性 显示 结果 遗传分析 洞庭湖 规律 |
| 文章编号： | 1000-3207(2008)02-0207-06 |
| 修稿时间： | 2006年5月29日 |
Development and characterization of polymorphic Est markers in common carp |
| |
| WANG Chun-Yan,YU Xiao-Mu,TONG Jin-Gou.Development and characterization of polymorphic Est markers in common carp[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2008,12(2):1-212. |
| |
| Authors: | WANG Chun-Yan YU Xiao-Mu TONG Jin-Gou |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《水生生物学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《水生生物学报》下载免费的PDF全文 |
|
