首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
   检索      

基于454 GS FLX高通量测序的团头鲂ESTs中微卫星特征分析
引用本文:曾聪,高泽霞,罗伟,刘肖莲,王卫民.基于454 GS FLX高通量测序的团头鲂ESTs中微卫星特征分析[J].水生生物学报,2013(5).
作者姓名:曾聪  高泽霞  罗伟  刘肖莲  王卫民
作者单位:1. 华中农业大学水产学院,农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室,农业部淡水生物繁育重点实验室,武汉 430070
2. 华中农业大学水产学院,农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室,农业部淡水生物繁育重点实验室,武汉 430070; 淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心,武汉 430070
基金项目:国家大宗淡水鱼类产业技术体系建设项目,国家自然科学基金,中央高校基本科研业务费专项资金,海大集团团头鲂育种专项资助
摘    要:微卫星或简单重复序列(Simple Sequence Repeat, SSR)广泛存在真核生物的基因组中,因其数量丰富、多态性高、共显性等特点1], SSR标记被公认为目前遗传学研究中最令人信赖的分子标记之一,被广泛应用于动植物的遗传研究和育种实践中。其中,表达序列标签(Expressed Sequence Tag, EST)微卫星(EST-SSR)反映基因的编码部分,可以为功能基因提供绝对标记,充分反映基因组功能区域的相似程度。所以它在遗传作图、资源多样性、功能基因的发现与定位、物种起源与进化和比较基因组学研究等方面都有重要的利用价值。近年来,功能基因组学的发展促进了 EST 测序工作的开展,而新一代高通量测序技术更是为 EST 测序带来了革命性的变化。与传统的Sanger测序技术相比,新一代测序平台最大的变化是无需克隆这一繁琐的过程,而是使用接头进行高通量的并行PCR、测序反应,并结合微流体技术,利用高性能的计算机对大规模的测序数据进行拼接和分析,从而可获得大量的序列数据。

关 键 词:团头鲂  EST-SSR  特征

CHARACTERISTICS OF MICROSATELLITES IN BLUNT SNOUT BREAM (MEGALOBRAMA AMBLYCEPHALA) EST SEQUENCES USING 454 FLX
ZENG Cong , GAO Ze-Xia , LUO Wei , LIU Xiao-Lian , WANG Wei-Min.CHARACTERISTICS OF MICROSATELLITES IN BLUNT SNOUT BREAM (MEGALOBRAMA AMBLYCEPHALA) EST SEQUENCES USING 454 FLX[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2013(5).
Authors:ZENG Cong  GAO Ze-Xia  LUO Wei  LIU Xiao-Lian  WANG Wei-Min
Abstract:
Keywords:Megalobrama amblycephala  EST-SSR  Characteristics
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号