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黑斑原(鱼兆)微卫星DNA富集文库构建与鉴定
引用本文:郭宝英,谢从新,祁鹏志,吴常文,邓一兵.黑斑原(鱼兆)微卫星DNA富集文库构建与鉴定[J].水生生物学报,2011,35(6):908-912.
作者姓名:郭宝英  谢从新  祁鹏志  吴常文  邓一兵
作者单位:1. 浙江海洋学院,浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室,舟山,316004;华中农业大学水产学院,武汉,430070
2. 华中农业大学水产学院,武汉,430070
3. 浙江海洋学院,浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室,舟山,316004
基金项目:国家海洋公益性行业科研专项,国家自然科学基金项目,海洋渔业科学与技术浙江省重中之重学科开放课题,农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室开放课题
摘    要:采用磁珠富集法,利用生物素标记的(CA)12寡核苷酸探针从黑斑原(鱼兆)基因组DNA MboI酶切的400—1000 bp片段中筛选CA/GT微卫星位点,洗脱的杂交片段克隆到pMD18-T载体上构建富集微卫星基因组文库后,通过PCR筛选检测出720个阳性克隆,占所有克隆的89.2%,从阳性克隆中随机选取139个进行测序,序列分析发现,124个克隆含有7个以上的重复序列,其中完全的为80个(64.5%),不完全的为40个(32.3%),复合的为15个(3.2%),重复次数范围为7—165次,平均为52次。在124条序列中共59条可以设计引物。

关 键 词:黑斑原(鱼兆)  微卫星  磁珠富集  DNA文库  构建

CONSTRUCTION AND IDENTIFICATION OF DNA LIBRARIES ENRICHED FOR MICROSATELLITE REPEAT SEQUENCES OF GLYPTOSTERNUM MACULATUM
GUO Bao-Ying,XIE Cong-Xin,QI Peng-Zhi,WU Chang-Wen,DENG Yi-Bing.CONSTRUCTION AND IDENTIFICATION OF DNA LIBRARIES ENRICHED FOR MICROSATELLITE REPEAT SEQUENCES OF GLYPTOSTERNUM MACULATUM[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2011,35(6):908-912.
Authors:GUO Bao-Ying  XIE Cong-Xin  QI Peng-Zhi  WU Chang-Wen  DENG Yi-Bing
Institution:1(1.Key Laboratory of Mariculture Equipments and Engineering Technology of Zhejiang Province,Marine Science College,Zhejiang Ocean University,Zhoushan 316004,China;2.College of Fisheries,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China)
Abstract:
Keywords:
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