首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
   检索      

湖北钉螺肝胰腺cDNA文库的构建和序列分析
引用本文:朱丹丹,赵琴平,聂品.湖北钉螺肝胰腺cDNA文库的构建和序列分析[J].水生生物学报,2011,35(4):672-680.
作者姓名:朱丹丹  赵琴平  聂品
作者单位:1. 中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉430072
2. 武汉大学基础医学院,武汉,430071
基金项目:中国科学院知识创新工作重要方向性项目,国家自然科学基金
摘    要:以湖北钉螺肝胰腺为材料构建cDNA文库。文库初始滴度为5.6×104 cfu/mL,库容量为6.72×105 cfu/mL,重组率为93%。插入片段长度为400—2700 bp。对其中1728个克隆进行测序,得到1520个序列,其中长度大于100 bp的ESTs为1393条,初步拼接得到698个单基因簇(Unigene),其中包括234个重叠群(Contig),464个单拷贝(Singleton)EST。使用BLAST软件进行同源性分析,结果显示有111个单基因簇具有不同程度的同源性,约占15.90%;587个单基因簇与所有已发现的蛋白质的基因没有或者有着相当低的同源性,约占84.10%。研究为湖北钉螺的基因学研究提供了重要的基础资料,同时亦为筛选和鉴定湖北钉螺生长发育、免疫等相关的功能基因以及血吸虫与螺之间的相互关系奠定了基础。

关 键 词:湖北钉螺  肝胰腺  cDNA文库  EST

CONSTRUCTION AND ANALYSIS ON CDNA LIBRARY OF ONCOMELANIA HUPENSIS HEPATOPANCREAS
ZHU Dan-Dan,ZHAO Qin-Ping,NIE Pin.CONSTRUCTION AND ANALYSIS ON CDNA LIBRARY OF ONCOMELANIA HUPENSIS HEPATOPANCREAS[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2011,35(4):672-680.
Authors:ZHU Dan-Dan  ZHAO Qin-Ping  NIE Pin
Institution:1(1.State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology,Institute of Hydrobiology,Chinese Academy of Sciences,Wuhan 430072,China;2.Department of Medical Parasitology and Research Laboratory of Schistosomiasis,Medical School of Wuhan University,Wuhan 430071,China)
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号