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| 鳙Sox基因克隆及序列进化分析 | |
| 引用本文： | 郭稳杰,俞小牧,童金苟.鳙Sox基因克隆及序列进化分析[J].水生生物学报,2014,38(4):664-668. |
| 作者姓名： | 郭稳杰 俞小牧 童金苟 |
| 作者单位： | 1. 中国科学院水生生物研究所, 武汉 430072; 2. 中国科学院大学, 北京 100049 |
| 基金项目： | 公益性（农业）行业科研项目（200903045）；国家自然科学基金项目（31272647）资助 |
| 摘 要： | 利用简并引物SoxN和Sox9在鳙基因组DNA中进行PCR扩增和产物克隆测序,并对序列进行同源性比较和系统进化分析。结果表明本文鉴定出鳙15个Sox基因HMG盒序列,分别属于SoxB、SoxC和SoxE组,依据斑马鱼同源基因将其分别命名为Sox1a、Sox1b、Sox2、Sox3、Sox4a、Sox4b、Sox9a、Sox9b、Sox10、Sox11b、Sox12、Sox14a、Sox14b、Sox19和Sox21a。基于鳙和斑马鱼Sox1、Sox4和Sox9基因核苷酸序列构建的系统进化树显示这3个Sox基因的复制时间发生在鳙和斑马鱼的分化之前,结果支持了鱼类特异的基因组复制假说。以Sox1a、Sox1b和Sox4基因为分子钟标记构建系统进化树探讨鳙和斑马鱼的分化时间,结果显示,同属于鲤科鱼类的鳙(鲤亚科)和斑马鱼(鱼丹亚科)在原始的鱼丹亚科鱼类中存在一个共同祖先,大约出现在63.7百万年前。研究结果为进一步研究鱼类Sox基因复制和基因组进化等问题提供了重要参考资料。 |
| 关 键 词： | 鳙 Sox基因 基因组加倍 系统进化树 分化时间 |
| 收稿时间： | 2013-04-23 |
CLONING AND SEQUENCE EVOLUTION ANALYSIS OF SOX GENESIN BIGHEAD CARP (ARISTICHTHYS NOBILIS) |
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| GUO Wen-Jie,YU Xiao-Mu,TONG Jin-Gou.CLONING AND SEQUENCE EVOLUTION ANALYSIS OF SOX GENESIN BIGHEAD CARP (ARISTICHTHYS NOBILIS)[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2014,38(4):664-668. | |
| Authors: | GUO Wen-Jie YU Xiao-Mu TONG Jin-Gou |
| Institution: | 1. Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430072, China; 2. University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | Aristichthys nobilis Sox gene Genome duplication Phylogenetic tree Divergenc time |
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