| 池蝶蚌线粒体基因组全序列分析简 |
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| 引用本文： | 盛军庆,林巧惠,王军花,彭扣,洪一江.池蝶蚌线粒体基因组全序列分析简[J].水生生物学报,2014,38(2):320-327. |
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| 作者姓名： | 盛军庆 林巧惠 王军花 彭扣 洪一江 |
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| 作者单位： | 南昌大学生命科学与食品工程学院, 南昌 330031 |
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| 基金项目： | 国家公益性行业科研专项（200903028）；国家自然科学基金（31160534）；江西省科技落地计划（12001）；江西省自然科学基金（20122BAB204016）资助 |
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| 摘 要： | 采用普通PCR扩增、SHOT-GUN测序、软件拼接首次获得了池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)线粒体基因组全序列。线粒体基因组全长为15939 bp,由13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个SrRNA基因和28个长度为1—393 bp的非编码区组成;除ND3-ND5、ND4L、ATP6、ATP8、COX1-COX3、tRNA-D、tRNA-H之外,其他大多数基因在L链编码。池蝶蚌线粒体全基因组序列、蛋白编码基因、tRNA基因、rRNA基因及非编码区的A+T含量分别为60.36%、59.84%、61.7%、60.23%及62.5%,与其他淡水蚌类一致,均表现出A+T偏好性,淡水蚌类线粒体基因组长度的差异主要表现在非编码区长度的差异。池蝶蚌mtDNA的COX2-12SrRNA区域基因排列存在差异,是ND3、tRNAHis、tRNAAla、tRNASer1、tRNASer2、tRNAGlu、ND2、tRNAMet 8个基因发生重组造成。22个tRNA基因都具有典型的三叶草二级结构,tRNA-E与tRNA-W间的非编码区含有一个ORF区,而控制区并未发现。从GenBank上下载的14种双壳纲贝类的mtDNA序列构建的系统进化树,显示池蝶蚌与三角帆蚌亲缘关系最近。研究结果为淡水珍珠蚌线粒体基因重排及进化特征提供理论依据。
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| 关 键 词： | 池蝶蚌 线粒体基因组 序列分析 基因重排 |
| 收稿时间： | 2013-04-16 |
COMPLETE SEQUENCE ANALYSIS OF MITOCHONDRIAL GENOME IN HYRIOPSIS SCHLEGELII |
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| Sheng Jun-qing,Lin Qiao-hui,Wang Jun-hua,Peng Kou,Hong Yi-jiang.COMPLETE SEQUENCE ANALYSIS OF MITOCHONDRIAL GENOME IN HYRIOPSIS SCHLEGELII[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2014,38(2):320-327. |
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| Authors: | Sheng Jun-qing Lin Qiao-hui Wang Jun-hua Peng Kou Hong Yi-jiang |
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| Institution: | School of Life Sciences and Food Engineering, Nanchang University, Nanchang 330031, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hyriopsis schlegelii Mitochondrial genome Sequence analysis Gene rearrangement |
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