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| 基于线粒体COⅠ基因的沙鳅亚科鱼类DNA条形码及其分子系统发育研究 | |
| 引用本文： | 毛云涛,甘小妮,王绪祯.基于线粒体COⅠ基因的沙鳅亚科鱼类DNA条形码及其分子系统发育研究[J].水生生物学报,2014,38(4):737-744. |
| 作者姓名： | 毛云涛 甘小妮 王绪祯 |
| 作者单位： | 1. 中国科学院水生生物研究所, 水生生物多样性与保护重点实验室, 武汉 430072; 2. 中国科学院大学, 北京 100049 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31272290）资助 |
| 摘 要： | 选择线粒体COⅠ基因作为分子标记,进行沙鳅亚科鱼类(Botiinae)DNA条形码及其分子系统发育研究。研究获得了沙鳅亚科7属19种共131个个体的COⅠ基因序列,利用MEGA5.0软件分析了沙鳅亚科鱼类COⅠ基因的序列特征,计算了种内及种间遗传距离。沙鳅亚科鱼类的分子系统发育关系的重建分别采用NJ法和Bayesian法。研究发现,沙鳅亚科COⅠ基因的碱基组成为:A 24.4%、T 29.5%、G 18.0%、C 28.1%。沙鳅亚科鱼类种内平均遗传距离为0.002±0.000,种间平均遗传距离为0.148±0.008。DNA条形码研究结果显示,所分析的19种沙鳅鱼类各自分别聚成单系分支,表明COⅠ基因在本研究中具有100%的物种鉴别率。同时,系统发育分析支持各属的单系性,并且结果显示沙鳅亚科鱼类聚为两个分支,其中一支由薄鳅属和副沙鳅属构成,另一分支则包括:(沙鳅属、色鳅属)和中华沙鳅属、(缨须鳅属、安彦鳅属)]。因此,COⅠ基因可以作为有效的分子标记对沙鳅亚科进行DNA条形码研究以及分子系统发育研究。 |
| 关 键 词： | DNA条形码 COⅠ基因 沙鳅亚科 物种鉴定 |
| 收稿时间： | 2013-05-28 |
DNA BARCODES AND MOLECULAR PHYLOGENY OF BOTIINAE FISHES BASED ON THE MITOCHONDRIAL COⅠ GENE |
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| MAO Yun-Tao,GAN Xiao-Ni,WANG Xu-Zhen.DNA BARCODES AND MOLECULAR PHYLOGENY OF BOTIINAE FISHES BASED ON THE MITOCHONDRIAL COⅠ GENE[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2014,38(4):737-744. | |
| Authors: | MAO Yun-Tao GAN Xiao-Ni WANG Xu-Zhen |
| Institution: | 1. The Key Laboratory of Aquatic Biodiversity and Conservation of Chinese Academy, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430072, China; 2. University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | DNA barcoding COⅠ gene Botiinae Species identification |
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