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建鲤ODC1基因型与增重的相关性分析
引用本文:李红霞,李建林,唐永凯,俞菊华.建鲤ODC1基因型与增重的相关性分析[J].水生生物学报,2014,38(3):414-421.
作者姓名:李红霞  李建林  唐永凯  俞菊华
作者单位:中国水产科学研究院淡水渔业研究中心, 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室, 无锡 214081
基金项目:国家科技部“863计划”项目(2011AA100401);公益性行业(农业)科研专项(200903045);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-46);鲤肉质相关分子标记的挖掘(2013JBFM03)资助
摘    要:构建了建鲤(Cyprinus carpio var.jian)鸟氨酸脱羧酶(Ornithine decarboxylase,ODC)jlODC1a基因上6个和jlODC1b基因上4个SNP位点的PCR-RFLP方法,检测了这10个位点在12个家系约900尾建鲤选育群体中的基因型,各位点的基因型频率存在差异,最小等位基因频率(MAF)为0.14—0.48。各位点不同基因型与增重相关分析结果,其中7个SNPs与建鲤增重显性相关的位点,ODC1s基因上与雌鱼增重相关的SNP位点(7个)较雄鱼(4个)多。标记富集结果表明富集与建鲤增重相关的优势基因型的SNP个数越多的个体增重速度越快SNP个数越多的个体增重速度越快,富集4个的平均增重显著快于富集0—3的个体增重,且比0标记的快约14%,这反映出生长为数量性状。进一步对所检测位点进行双倍型分析,结果显示具有四个优势基因型且全部杂合优势基因型的4567(XXXXXXACCTCTCT)组的增重最快,比0优势基因型的增重快达26.6%,可以考虑用于今后的快增长建鲤的选育计划中。此外,双倍型分析结果还表明,不同位点之间可能存在或颉抗或协同的互作,如1和4之间存在拮抗关系,因此在今后的选育计划中,在考虑标记富集的情况下还应考虑标记之间的关系。宜在选择互为协同作用优势基因型的前提下,富集尽可能多的SNP标记。

关 键 词:建鲤  鸟氨酸脱羧酶  基因型  SNP-增重相关分析
收稿时间:2013-04-16

CORRELATION ANALYSIS BETWEEN BODY WEIGHT GAIN AND ODC1 GENOTYPES IN CYPRINUS CARPIO var. JIAN
LI Hong-Xia,LI Jian-Lin,TANG Yong-Kai,YU Ju-Hua.CORRELATION ANALYSIS BETWEEN BODY WEIGHT GAIN AND ODC1 GENOTYPES IN CYPRINUS CARPIO var. JIAN[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2014,38(3):414-421.
Authors:LI Hong-Xia  LI Jian-Lin  TANG Yong-Kai  YU Ju-Hua
Institution:Key Laboratory of Freshwater Fisheries and Germplasm Resources Utilization, Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuxi 214081, China
Abstract:
Keywords:Cyprinus carpio var  jian  Ornithine decarboxylase  Genotype  SNP-weight gain correlated analysis
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