| 我国口岸瓜实蝇监测样本的SSR分子标记分析 |
| |
| 引用本文： | 许佳丹,王书平,蒋费涛,朱雅君,叶军,李飞.我国口岸瓜实蝇监测样本的SSR分子标记分析[J].生物安全学报,2019,28(4):259-268. |
| |
| 作者姓名： | 许佳丹 王书平 蒋费涛 朱雅君 叶军 李飞 |
| |
| 作者单位： | 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心, 上海 201708;浙江大学昆虫科学研究所, 浙江 杭州 310058,上海海关动植物与食品检验检疫技术中心, 上海 201708,重庆三峡学院环境与化学工程学院, 重庆 404000,上海海关动植物与食品检验检疫技术中心, 上海 201708,上海海关动植物与食品检验检疫技术中心, 上海 201708,浙江大学昆虫科学研究所, 浙江 杭州 310058 |
| |
| 基金项目： | 国家重点研发计划项目（2017YFC1200602）；上海出入境检验检疫局科技项目（HK16-010） |
| |
| 摘 要： | 目的] 瓜实蝇是世界性检疫害虫，被列入我国口岸常年监测计划中。本研究以检疫性有害生物瓜实蝇为研究对象，利用不同地理种群瓜实蝇的转录组发现特异性的微卫星（simple sequence repeats，SSR）序列，分析我国口岸监测的瓜实蝇样本的遗传多样性。方法] 利用生物信息学方法，对4个不同地理来源的瓜实蝇转录组进行分析，发现了特异性的SSR序列，并设计特异性引物，选用我国11个省市的49个瓜实蝇监测样本进行测试及验证，使用NTsys和Popgene 32软件进行遗传多样性分析。结果] 筛选出15对多态性较好的引物，UPGMA聚类分析显示，新疆、四川和广西种群归为一支，浙江、广东、江苏种群归为一支，上海、云南、海南、天津种群归为一支，北京种群单独聚为一支。结论] 聚类分析结果显示，11个不同省市的瓜实蝇监测样本间基因分化系数为0.6712，表明不同口岸的瓜实蝇监测样本间的遗传分化较大，可能具有不同的来源地，可为进一步开发监测样本溯源技术提供理论依据。
|
| 关 键 词： | 瓜实蝇 转录组 微卫星标记 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2018/9/13 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/10/11 0:00:00 |
Simple sequence repeats analysis of Bactrocera cucurbitae populations from custom ports in China |
| |
| XU Jiadan,WANG Shuping,JIANG Feitao,ZHU Yajun,YE Jun and LI Fei.Simple sequence repeats analysis of Bactrocera cucurbitae populations from custom ports in China[J].Journal of Biosafety,2019,28(4):259-268. |
| |
| Authors: | XU Jiadan WANG Shuping JIANG Feitao ZHU Yajun YE Jun and LI Fei |
| |
| Institution: | Technical Center for Animal Plant and Food Inspection and Quarantine, Shanghai Customs, Shanghai 201708, China;Institute of Insect Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang 310058, China,Technical Center for Animal Plant and Food Inspection and Quarantine, Shanghai Customs, Shanghai 201708, China,School of Environmental and Chemical Engineering, Chongqing Three Gorges University, Chongqing 404000, China,Technical Center for Animal Plant and Food Inspection and Quarantine, Shanghai Customs, Shanghai 201708, China,Technical Center for Animal Plant and Food Inspection and Quarantine, Shanghai Customs, Shanghai 201708, China and Institute of Insect Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang 310058, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
|
| 点击此处可从《生物安全学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《生物安全学报》下载免费的PDF全文 |
|
