| 扩散型与繁殖型松材线虫数字基因表达谱对比分析 |
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| 引用本文： | 田浩楷,张帅,柳小龙,张志伟,赵莉蔺.扩散型与繁殖型松材线虫数字基因表达谱对比分析[J].生物安全学报,2017,26(2):111-121. |
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| 作者姓名： | 田浩楷 张帅 柳小龙 张志伟 赵莉蔺 |
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| 作者单位： | 山西农业大学林学院, 山西 太谷 030801;中国科学院动物研究所, 农业虫害鼠害综合治理研究国家重点 实验室, 北京 100101,中国农业科学院植物保护研究所, 植物病虫害生物学国家重点实验室, 北京 100193,山西农业大学林学院, 山西 太谷 030801;中国科学院动物研究所, 农业虫害鼠害综合治理研究国家重点 实验室, 北京 100101,山西农业大学林学院, 山西 太谷 030801,中国科学院动物研究所, 农业虫害鼠害综合治理研究国家重点 实验室, 北京 100101 |
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| 基金项目： | 林业公益性行业科研专项（201204501）；国家自然科学基金（31572272，31272323）；中国科学院创新工程项目（KSCX2-EW-J-2）；中国科学院前沿科学重点研究项目（QYZDB-SSW-SMC014）；国家高技术研究发展计划（“863”计划：2014AA020529） |
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| 摘 要： | 【目的】松材线虫作为林业重大外来入侵种,扩散型幼虫的形成对其传播扩散起着非常重要的作用,但扩散虫态的形成与维持机制尚未阐明。【方法】通过构建松材线虫数字基因表达谱(DGE),从滞育状态的维持、化学感受、代谢途径等方面分析松材线虫不同虫态的基因表达差异。【结果】参考松材线虫基因组数据,鉴定出2种扩散型幼虫(LⅢ,LⅣ)和繁殖型幼虫(Ln)各有11184、8533和10781个基因。相对于繁殖型虫态,大多数基因在LⅣ中下调表达,该虫态中特异上调表达的基因有化感受体基因、核受体基因以及一些代谢相关基因。推测这可能与扩散型线虫滞育状态的维持相关,并在其生理功能如化学感受和媒介/寄主互作中发挥作用。GO和Pathway富集分析显示,多数代谢相关通路在LⅣ中下调表达,而在LⅢ中的表达均活跃。【结论】以上结果与LⅣ处于不进食、总体代谢水平较低等生理状态的表型相一致。
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| 关 键 词： | 松材线虫 扩散型虫态 数字基因表达谱 差异表达基因 |
| 收稿时间： | 2016/12/11 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2017/1/20 0:00:00 |
Comparative analysis of dispersal and propagative larval stages in the pinewood nematode (Bursaphelenchus xylophilus) based on a digital gene expression library |
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| TIAN Haokai,ZHANG Shuai,LIU Xiaolong,ZHANG Zhiwei and ZHAO Lilin.Comparative analysis of dispersal and propagative larval stages in the pinewood nematode (Bursaphelenchus xylophilus) based on a digital gene expression library[J].Journal of Biosafety,2017,26(2):111-121. |
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| Authors: | TIAN Haokai ZHANG Shuai LIU Xiaolong ZHANG Zhiwei and ZHAO Lilin |
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| Institution: | College of Forestry, Shanxi Agricultural University, Taigu, Shanxi 030801, China;State Key Laboratory of Integrated Management of Pest Insects and Rodents, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China,State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases and Insect Pests, Institute of Plant Protection, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, China,College of Forestry, Shanxi Agricultural University, Taigu, Shanxi 030801, China;State Key Laboratory of Integrated Management of Pest Insects and Rodents, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China,College of Forestry, Shanxi Agricultural University, Taigu, Shanxi 030801, China and State Key Laboratory of Integrated Management of Pest Insects and Rodents, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | pinewood nematode dispersal larva digital gene expression differential gene expression |
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