| 一种HBV研究的新动物模型-喜马拉雅旱獭β-actin基因的克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 冯雪梅,尹莹,李安意,朱珍妮,陶元清,王忠东,陆蒙吉,杨东亮,王宝菊.一种HBV研究的新动物模型-喜马拉雅旱獭β-actin基因的克隆及序列分析[J].国外医学：分子生物学分册,2011(2):95-99. |
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| 作者姓名： | 冯雪梅 尹莹 李安意 朱珍妮 陶元清 王忠东 陆蒙吉 杨东亮 王宝菊 |
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| 作者单位： | [1]华中科技大学同济医学院附属同济医院临床免疫研究室,武汉市430030 [2]华中科技大学同济医学院附属同济医院实验动物中心,武汉市430030 [3]青海省地方病预防控制所实验动物中心,西宁市811602 [4]德国Duisburg-Essen大学医学院病毒学研究所,德国埃森45122 |
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| 基金项目： | 国家重大传染病防治专项课题（No.2008ZX10002-011） |
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| 摘 要： | 目的 喜马拉雅旱獭对土拨鼠肝炎病毒（woodchuck hepatitis virus,WHV）高度易感,可作为HBV感染的新动物模型.本研究对喜马拉雅旱獭β肌动蛋白（β-actin）的部分cDNA序列进行了克隆和序列分析,为喜马拉雅旱獭在HBV感染研究中的应用奠定基础.方法 根据Genbank的土拨鼠β-actin cDNA的序列设计特异性引物,提取旱獭脾组织总RNA作为模板,RT-PCR扩增旱獭β-actin cDNA序列;PCR产物纯化后连接至T载体（pMD18-T）,构建重组质粒pMD18-T-mhActin.对重组质粒进行PCR初筛及酶切鉴定,选择阳性克隆测序;对所获得的序列进行同源性和种系进化分析.结果 获得的旱獭β-actin序列为349 bp（nt887～1 235）,其中编码序列为323 bp（nt-887～1209）,编码106个氨基酸,包含形成二硫键的2个丝氨酸位点（氨基酸16和氨基酸105）及与β-actin功能相关的2个ATP结合位点、6个凝溶胶蛋白结合位点和6个profilin结合位点.同源性分析发现上述序列与其它哺乳动物β-actin的同源性均高达88 %以上,与土拨鼠β-actin的同源性最高（99.69 %）,其氨基酸序列的同源性为100 %.种系进化树分析提示喜马拉雅旱獭β-actin与土拨鼠β-actin的亲缘关系最近,其次为其它啮齿类动物.结论 成功克隆了喜马拉雅旱獭β-actin的部分序列.序列分析发现喜马拉雅旱獭β-actin与土拨鼠β-actin的同源性最高.
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| 关 键 词： | 乙型肝炎病毒 喜马拉雅旱獭 肌动蛋白 序列分析 |
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