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昭苏县野生羊肚菌根际土壤细菌多样性研究
引用本文:杨晓绒,赖晓辉,吾尔恩·阿合别尔迪,焦子伟,张相锋.昭苏县野生羊肚菌根际土壤细菌多样性研究[J].微生物学杂志,2020(4):24-33.
作者姓名:杨晓绒  赖晓辉  吾尔恩·阿合别尔迪  焦子伟  张相锋
作者单位:伊犁师范大学 生物与地理科学学院, 新疆 伊宁 835000
基金项目:伊犁师范大学微生物重点实验室科研项目(YLUKLM2018001)
摘    要:采集昭苏县野生羊肚菌(Morchella esculenta)根际水平直径10 cm、深度0~30 cm范围内的3层各10 cm土壤样品,利用Illumina miseq 2×300 bp高通量测序技术和生物信息学分析方法检测细菌类群的多样性。结果显示,细菌群落Chao和Shannon指数在0~30 cm土层中的平均值分别为152和3.68,且两种指数在10~20 cm土层均最高;细菌群落在各分类水平上的类群(最大类群丰度)分别为变形菌门(Proteobacteria,36.3%)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)等13门;黄杆菌科(Flavobacteriaceae,8.4%)、芽胞杆菌科(Bacillaceae)和葡萄球菌科(Staphylococcaceae)等43科;葡萄球菌属(Staphylococcus,7.1%)、杆状菌属(Bacillus)和Cloacibacterium等52属;不能培养的α-变形杆菌(uncultured α-proteobacterium,2.0%)、不能培养的嗜甲基菌科1种(uncultured Methylophilaceae bacterium)和路西法芽胞杆菌(Bacillus luciferensis)等44种。检测到固氮菌32属,包括15属自生固氮菌、9属共生固氮菌和8属联合固氮菌。结果表明,羊肚菌土壤根际微生物样品中细菌类群具有多样性,10~20 cm土层根际微生物多样性较高,但很多种类丰度较低;该土样含有丰富的固氮菌,这对栽培羊肚菌如何选地或覆土具有一定的指导意义。

关 键 词:宏基因组  人工驯化  根际土壤微生物  固氮菌

Bacterial Diversity in Rhizosphere Soil of Wild Morels in Zhaosu County
YANG Xiao-rong,LAI Xiao-hui,OREN Akhberdi,JIAO Zi-wei,ZHANG Xiang-feng.Bacterial Diversity in Rhizosphere Soil of Wild Morels in Zhaosu County[J].Journal of Microbiology,2020(4):24-33.
Authors:YANG Xiao-rong  LAI Xiao-hui  OREN Akhberdi  JIAO Zi-wei  ZHANG Xiang-feng
Institution:Schl. of Biol. & Geograph. Sci., Yili Normal Uni., Yining, 835000
Abstract:
Keywords:megagenomics  artificial domestication  rhizosphere soil microbes  nitrogen-fixing bacteria
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