| 湘西地区猕猴桃溃疡病病原菌分离及其全基因组分析 |
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| 引用本文： | 杨睿,汪琳罗沙,姚迪,唐蕴哲,张婧一,彭清忠.湘西地区猕猴桃溃疡病病原菌分离及其全基因组分析[J].微生物学杂志,2024(1):58-67. |
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| 作者姓名： | 杨睿 汪琳罗沙 姚迪 唐蕴哲 张婧一 彭清忠 |
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| 作者单位： | 吉首大学 生物资源与环境科学学院，湖南 吉首 416000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（32160009）；湖南省重点研发计划项目（2022NK2055） |
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| 摘 要： | 通过了解湘西地区猕猴桃溃疡病致病菌分类地位和基因类型，初步探讨其致病的分子机理。采用纯培养法分离猕猴桃溃疡病菌；基于16S～23S rRNA基因内转录间隔序列进行病原菌的系统发育分析；通过基因组测序和生物信息学分析解析其致病的分子机理。从“米良1号”和“红阳”猕猴桃感病枝条中分离获得5株溃疡病菌，编号为L211、L212、L321、L322、L323;通过形态特征和16S～23S rRNA基因内转录间隔序列分析，鉴定5株细菌均为丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidae,Psa)。以菌株L211为代表进行体外猕猴桃枝条接种实验表明能引起典型溃疡病症状。通过菌株L211的全基因组测序和生物信息学分析，获得5 741条基因数目，长5 412 072 bp;基因功能注释发现菌株L211携带121种毒力因子、71个植物互作因子和77个耐药基因；同时，基因组单核苷酸多态性分析发现病原菌L211为基因Ⅲ型Psa。引起湘西地区猕猴桃溃疡病的病原菌是丁香假单胞菌猕猴桃致病变种基因Ⅲ型，与国内外报道的引起猕猴桃溃疡病大流行的致病菌一致。猕猴桃溃疡病发病...
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| 关 键 词： | 猕猴桃溃疡病 丁香假单胞菌猕猴桃致病变种 鉴定 全基因组测序 致病机理 |
Isolation of Kiwifruit Canker Pathogen in Western Hunan and Whole Genome Sequencing Analysis of Its Pathogenic Mechanism |
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| YANG Rui,WANG Linluo-sh,YAO Di,TANG Yun-zhe,ZHANG Jing-yi,PENG Qing-zhong.Isolation of Kiwifruit Canker Pathogen in Western Hunan and Whole Genome Sequencing Analysis of Its Pathogenic Mechanism[J].Journal of Microbiology,2024(1):58-67. |
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| Authors: | YANG Rui WANG Linluo-sh YAO Di TANG Yun-zhe ZHANG Jing-yi PENG Qing-zhong |
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| Institution: | Coll. of Bio-Res. & Environ. Sci., Jishou Uni., Jishou 416000 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | kiwifruit canker disease Pseudomonas syringae pv Actinidae identification whole genome sequencing pathogenic mechanism |
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