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厌氧砷还原细菌(Clostridiumsp. ZY1)分离鉴定及基因组分析
引用本文:张堃,周媛,黄华枝,廖俊杰,朱永闯,李湘伟,李林,黄伟忠,房保柱,李文均,李金天,廖斌.厌氧砷还原细菌(Clostridiumsp. ZY1)分离鉴定及基因组分析[J].微生物学杂志,2021(2):27-36.
作者姓名:张堃  周媛  黄华枝  廖俊杰  朱永闯  李湘伟  李林  黄伟忠  房保柱  李文均  李金天  廖斌
作者单位:广东轻工职业技术学院, 广东 广州 510300;中山大学 生命科学学院, 广东 广州 510275;华南师范大学 生命科学学院生态科学研究所, 广东 广州 510631
基金项目:广东省自然科学基金项目(2018A0303130014);广东省教育厅特色创新项目(自然科学2018GKTSCX091);广东轻工职业技术学院自然科学项目(KJ2020-003);广东轻工职业技术学院校级专业领军人才项目(KYRC2020-004)
摘    要:为了进一步了解砷矿区重金属污染环境中砷还原微生物多样性,利用厌氧富集手段,针对砷矿区底泥样品进行厌氧砷还原功能微生物资源的分离及纯培养,并结合基因组学对分离菌株进行初步分析。经过富集分离获得菌株ZY1,通过16S rRNA基因相似性及系统发育树分析,表明菌株ZY1属于梭菌属(Clostridium),菌株ZY1的最适pH范围为6.4~7.1,NaCl的耐受范围为0%~3%,菌株ZY1能够耐受100 mmol/L五价砷(As(Ⅴ)),三价砷(As(Ⅲ))的耐受浓度仅为1.98 mmol/L。菌株ZY1基因组大小为4.4 Mbp,包含31个Scaffolds, N50为318 327 bp, GC含量为30.6%,预测得到4 210个基因。基因组信息表明,菌株ZY1具有砷还原的相关基因簇,并具有较好的抗逆代谢通路。研究结果可为矿山酸性废水底泥微生物多样性研究提供参考,并为砷污染环境的修复及生态治理研究提供菌种资源。

关 键 词:砷矿  砷酸盐还原细菌  基因组  纯培养  梭菌

Isolation, Identification and Genome Analysis of an Anaerobic Arsenic-Reducing Bacterium Clostridium sp. ZY1
ZHANG Kun,ZHOU Yuan,HUANG Hua-zhi,LIAO Jun-jie,ZHU Yong-chuang,LI Xiang-wei,LI Lin,HUANG Wei-zhong,Fang Bao-zhu,LI Wen-jun,LI Jin-tian,LIAO Bin.Isolation, Identification and Genome Analysis of an Anaerobic Arsenic-Reducing Bacterium Clostridium sp. ZY1[J].Journal of Microbiology,2021(2):27-36.
Authors:ZHANG Kun  ZHOU Yuan  HUANG Hua-zhi  LIAO Jun-jie  ZHU Yong-chuang  LI Xiang-wei  LI Lin  HUANG Wei-zhong  Fang Bao-zhu  LI Wen-jun  LI Jin-tian  LIAO Bin
Institution:Guangdong Indust. Polytech., Guangzhou 510300;Schl. of Life Sci., Sun Yat Sen Uni., Guangzhou 510275;Inst. of Eco Sci., Schl. of Life Sci., S. China Normal Uni., Guangzhou 510631
Abstract:
Keywords:
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