| 基于分级过滤的自然水体原核微生物群落分析 |
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| 引用本文： | 宋家梁,张汝毅,邹斌,全哲学.基于分级过滤的自然水体原核微生物群落分析[J].微生物学杂志,2020(3):8-16. |
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| 作者姓名： | 宋家梁 张汝毅 邹斌 全哲学 |
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| 作者单位： | 复旦大学 生命科学学院， 上海 200438 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目（31870109） |
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| 摘 要： | 自然水体中微生物种类丰富,采集了上海周边的湖水、河水、海(岸)水、井水四类水体各两处样品,设计了含0.1μm终端截留孔径的半自动分级过滤装置分离富集不同粒径的水体微生物,使用原核微生物通用引物对16S rRNA基因V3+V4区扩增,高通量测序获得序列,对四类水体中的微生物群落进行比较分析,关注了能穿透0.22μm常规除菌过滤孔径的超微小微生物。结果显示水体环境主导了微生物的群落差异,河水与湖水中的群落总体接近,不同于海(岸)水和井水;海(岸)水和井水的微生物群落差异较大。0.1μm上截留的优势超微小微生物在河水与湖水样品中均为Proteobacteria门SAR11 clade目的Clade Ⅲ和Actinobacteria门Sporichthyaceae科HgcI clade,海(岸)水中为Proteobacteria门SAR11 clade目的Clade Ia和Nanoarchaeota门Woesearchaeia古菌,井水中为Nanoarchaeota门Woesearchaeia属古菌以及未定域或未分类的微生物。其中未定域的微生物16S rRNA基因在系统发育树上单独成簇,可能是古菌的一个新类型。本研究所使用的分级过滤装置显示了在发掘超微小微生物上的潜力。
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| 关 键 词： | 自然水体 原核微生物 群落分析 分级过滤 0.1 μm滤膜 超微小微生物 高通量测序 古菌 |
Natural Water Prokaryote Community Study Based on Grading Filtration |
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| SONG Jia-liang,ZHANG Ru-yi,ZOU Bin,QUAN Zhe-xue.Natural Water Prokaryote Community Study Based on Grading Filtration[J].Journal of Microbiology,2020(3):8-16. |
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| Authors: | SONG Jia-liang ZHANG Ru-yi ZOU Bin QUAN Zhe-xue |
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| Institution: | Schl. of Life Sci., Fudan Uni., Shanghai 200438 |
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