一种能识别DNA重复顺序的序列装配方案 |
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引用本文: | 盛泉虎,丁达夫.一种能识别DNA重复顺序的序列装配方案[J].生物化学与生物物理学报,1998,30(1):53-58. |
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作者姓名: | 盛泉虎 丁达夫 |
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作者单位: | 中国科学院上海生物化学研究所 |
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摘 要: | 提出一种能识别DNA重复顺序的序列装配方案。首先通过预筛选和序列联配来判断两处 否真正重叠。然后把来自不同重复区域的所有片段组建成一个重复重叠群(repeat contig),而其余片段建成单拷贝重叠群(nonrepeat contig)。接着重复重叠群被拆分成两个重叠群并与其余的单拷贝重叠群连接成全序列片段顺序。最后按照该全序列片段顺序进行序列多重联配,得到全序列。经过8个目标序列库的验证,表明
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关 键 词: | 全序列测定 重复区域 序列装配 DNA |
An Assembly Algorithm for DNA Sequence with Repeats |
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Abstract: | |
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Keywords: | Sequencing repetitive sequence sequence assembly |
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