| 文本挖掘技术在整合蛋白与疾病关系资源中的应用 |
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| 引用本文： | 徐昊,陶林,魏武,贾佩琳,丁祖泉,曹志伟.文本挖掘技术在整合蛋白与疾病关系资源中的应用[J].生物信息学,2009,7(1):21-24. |
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| 作者姓名： | 徐昊 陶林 魏武 贾佩琳 丁祖泉 曹志伟 |
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| 作者单位： | 1. 上海生物信息技术研究中心,上海,200235
2. 同济大学生命与科学技术学院,上海,200235 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划) |
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| 摘 要： | 为了整合文献中大量的人类蛋白质与疾病相互关系的信息，通过文本挖掘和通路分析的方法从PubMed中的摘要提取出对应关系后，利用KEGG中的通路信息构建出人类蛋白质和疾病相互的一个网络效应，并构建了查询数据库，用户可以根据蛋白质名称、疾病名称、通路名称来进行多方面的查询。
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| 关 键 词： | 文本挖掘 蛋白质 疾病 网络效应 |
The network effect about the human protein and disease relationship |
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| XU Hao,TAO Lin,WEI Wu,JIA Pei-lin,DING Zu-quan,CAO Zhi-wei.The network effect about the human protein and disease relationship[J].China Journal of Bioinformation,2009,7(1):21-24. |
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| Authors: | XU Hao TAO Lin WEI Wu JIA Pei-lin DING Zu-quan CAO Zhi-wei |
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| Institution: | 1. Shanghai Center for Bioinformation Technology, shanghai 200235, China; 2. College of Life Science and Technology, Tongji tmiversity, shanghai 200235, China) |
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| Abstract: | For intergrated large number of the relationships between human protein and disease, we through text mining to the PubMed abstract, identify the protein which leaded to disease, and combine with the KEGG pathway information to establish a network between protein and disease, and constructed a database for the user to use protein name, disease name and pathway name to query. |
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| Keywords: | Text mining Protein Disease Network effect |
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