| 甘蔗细胞色素P450还原酶基因的电子克隆与分析 |
| |
| 引用本文： | 苏炜华,张玉叶,黄宁,肖新换,黄珑,罗俊,阙友雄.甘蔗细胞色素P450还原酶基因的电子克隆与分析[J].生物信息学,2014,12(2):99-105. |
| |
| 作者姓名： | 苏炜华 张玉叶 黄宁 肖新换 黄珑 罗俊 阙友雄 |
| |
| 作者单位： | 福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗产业技术研发中心,福建 福州 350002;福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗产业技术研发中心,福建 福州 350002;福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗产业技术研发中心,福建 福州 350002;福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗产业技术研发中心,福建 福州 350002;福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗产业技术研发中心,福建 福州 350002;福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗产业技术研发中心,福建 福州 350002;福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗产业技术研发中心,福建 福州 350002 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(31340060)；农业部948项目(2014-S18)；教育部博士点基金(20103515120006)；福建农林大学杰出青年基金(xjq201202)资助。 |
| |
| 摘 要： | 旨在为甘蔗细胞色素P450还原酶基因的实验克隆、功能鉴定及其应用提供参考。本研究以甘蔗类似细胞色素P450还原酶基因的EST序列CF576130.1为探针,在甘蔗EST数据库中进行检索,并基于电子克隆技术获得了甘蔗细胞色素P450还原酶基因（Cytochrome P450 reductase）的一条cDNA全长序列,命名为ScCYP450。采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、亚细胞定位、跨膜结构域、疏水性/亲水性、高级结构及功能域等方面进行预测和分析。结果表明该基因全长1 821 bp,包含一个744 bp的开放阅读框,编码247个氨基酸,该基因编码蛋白定位于细胞内质网（膜）,为可溶性碱性蛋白,不存在信号肽,二级结构原件多为无规卷曲,含有多个保守功能域,主要功能为辅酶因子生物合成和翻译功能。
|
| 关 键 词： | 甘蔗 ScCYP450基因 电子克隆 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2013/12/7 0:00:00 |
Electronic cloning and characterization of sugarcane ScCYP450 gene using bioinformatics tools |
| |
| SU Weihu,ZHANG Yuye,HUANG Ning,XIAO Xinhuan,HUANG Long,LUO Jun and QUE Youxiong.Electronic cloning and characterization of sugarcane ScCYP450 gene using bioinformatics tools[J].China Journal of Bioinformation,2014,12(2):99-105. |
| |
| Authors: | SU Weihu ZHANG Yuye HUANG Ning XIAO Xinhuan HUANG Long LUO Jun and QUE Youxiong |
| |
| Institution: | Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,Ministry of Agriculture,Fujian Agriculture and Forestry University/Sugarcane Research & Development Center,China Agriculture Research System,Fuzhou 350002,China;Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,Ministry of Agriculture,Fujian Agriculture and Forestry University/Sugarcane Research & Development Center,China Agriculture Research System,Fuzhou 350002,China;Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,Ministry of Agriculture,Fujian Agriculture and Forestry University/Sugarcane Research & Development Center,China Agriculture Research System,Fuzhou 350002,China;Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,Ministry of Agriculture,Fujian Agriculture and Forestry University/Sugarcane Research & Development Center,China Agriculture Research System,Fuzhou 350002,China;Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,Ministry of Agriculture,Fujian Agriculture and Forestry University/Sugarcane Research & Development Center,China Agriculture Research System,Fuzhou 350002,China;Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,Ministry of Agriculture,Fujian Agriculture and Forestry University/Sugarcane Research & Development Center,China Agriculture Research System,Fuzhou 350002,China;Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,Ministry of Agriculture,Fujian Agriculture and Forestry University/Sugarcane Research & Development Center,China Agriculture Research System,Fuzhou 350002,China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Sugarcane ScCYP450 gene In silico cloning Bioinformatics |
| 本文献已被 维普 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《生物信息学》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《生物信息学》下载免费的PDF全文 |
|
