| 拟南芥GA2ox基因家族启动子分析 |
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| 引用本文： | 段秋红,赵小英,贺热情,郭明,刘德荣,唐冬英,刘选明.拟南芥GA2ox基因家族启动子分析[J].生物信息学,2013,11(4):275-281. |
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| 作者姓名： | 段秋红 赵小英 贺热情 郭明 刘德荣 唐冬英 刘选明 |
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| 作者单位： | 湖南大学生物学院,湖南 长沙410082;湖南大学生物学院,湖南 长沙410082;湖南大学生物学院,湖南 长沙410082;湖南大学生物学院,湖南 长沙410082;湖南大学生物学院,湖南 长沙410082;湖南大学生物学院,湖南 长沙410082;湖南大学生物学院,湖南 长沙410082 |
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| 基金项目： | 湖南省自然科学基金项目（No：11JJA002）;湖南省青年骨干教师项目（521298864）. |
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| 摘 要： | 赤霉素是一类重要的植物激素，它参与调节植物生长发育的各个阶段。真核基因的表达受多种因素的调控，其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要，但是目前对拟南芥GA2ox基因家族上游顺式元件的详细分析较少。本研究分析了AtGA2ox基因家族染色体定位、进化关系、蛋白模体以及顺式元件。分析结果表明：AtGA2ox基因家族分为2个亚类；具有相对集中的染色体分布：具有相似的内含子和外显子结构；AtGA2ox基因家族成员进化关系越相近，模体和顺式元件则越保守且分布位置更接近。PLACE和Plant CARE以及DMB分析显示，AtGA2ox基因家族存在许多保守元件，受多因素的调控，在此家族的上游调控区域普遍存在组织和器官特异性表达元件、光响应元停、激素响应元件以及其他环境响应元件。基因表达谱分析结果表明，在激素诱导下，AtGA2ox基因家族均有响应。这些元件不仅作为正调控元件，诱导部分AtGA2ox基因的表达，而且还能作为负调控元件．抑制其他AtGA2ox基因的表达。
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| 关 键 词： | AtGA2ox基因家族 启动子 顺式元件 进化 基因表达调控 |
| 收稿时间： | 2013/6/24 0:00:00 |
Promoter analysis of GA2ox gene family in Arabidopsis thaliana |
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| DUAN Qiu-hong,ZHAO Xiao-ying,HE Re-qing,GUO Ming,LIU De-rong,Tang Dong-ying and LIU Xuan-ming.Promoter analysis of GA2ox gene family in Arabidopsis thaliana[J].China Journal of Bioinformation,2013,11(4):275-281. |
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| Authors: | DUAN Qiu-hong ZHAO Xiao-ying HE Re-qing GUO Ming LIU De-rong Tang Dong-ying and LIU Xuan-ming |
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| Institution: | College of Biology, Hunan University, Changsha 410082, China;College of Biology, Hunan University, Changsha 410082, China;College of Biology, Hunan University, Changsha 410082, China;College of Biology, Hunan University, Changsha 410082, China;College of Biology, Hunan University, Changsha 410082, China;College of Biology, Hunan University, Changsha 410082, China;College of Biology, Hunan University, Changsha 410082, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | AtGA2ox Gene Family Promoter Cis-element Evolution Gene Expression Regulation |
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