| 人类蛋白组学草图的肺癌分子标记物初探 |
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| 引用本文： | 朱琰琰,罗执芬,崔永霞,卢创新,周云.人类蛋白组学草图的肺癌分子标记物初探[J].生物信息学,2016,14(1):43-48. |
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| 作者姓名： | 朱琰琰 罗执芬 崔永霞 卢创新 周云 |
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| 作者单位： | 河南省人民医院肿瘤科, 郑州 450003;郑州大学人民医院肿瘤科, 郑州 450003,河南省人民医院肿瘤科, 郑州 450003;郑州大学人民医院肿瘤科, 郑州 450003,河南省人民医院肿瘤科, 郑州 450003;郑州大学人民医院肿瘤科, 郑州 450003,河南省人民医院肿瘤科, 郑州 450003;郑州大学人民医院肿瘤科, 郑州 450003,河南省人民医院肿瘤科, 郑州 450003;郑州大学人民医院肿瘤科, 郑州 450003 |
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| 摘 要： | 传统的肺癌分子标记物探索通常基于基因组或者转录组研究,而基于蛋白质水平的肺癌分子标记物探索通常局限在低通量水平。质谱技术已经开始产生高通量的全局正常及癌症蛋白组。我们采用开源统计软件R对人类蛋白组学草图数据及已发表的肺癌蛋白质组学数据进行二次分析,筛选出91个潜在的候选肺癌分子标记物。基因注解分析显示候选肺癌基因富集了和代谢、TP53通路以及MicroRNA调控等相关的基因。最后,利用Human Protein Atlas数据库及Pubmed对前20候选标记物进行验证,结果显示大部分候选肺癌基因大多能够得到验证。可见数据挖掘在即将到来的质谱推动的组学大数据时代将发挥重要作用。
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| 关 键 词： | 蛋白质组 数据挖掘 肺癌 分子标记物 |
| 收稿时间： | 2015/10/26 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2015/12/16 0:00:00 |
Pilot study on biomarkers for lung cancer based on the draft of human proteome |
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| ZHU Yanyan,LUO Zhifen,CUI Yongxi,LU Chuangxin and ZHOU Yun.Pilot study on biomarkers for lung cancer based on the draft of human proteome[J].China Journal of Bioinformation,2016,14(1):43-48. |
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| Authors: | ZHU Yanyan LUO Zhifen CUI Yongxi LU Chuangxin and ZHOU Yun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Proteome Data mining Lung cancer Biomarkers |
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