|
|||||
|
|
| 拟南芥花药基因的共表达分析 | |
| 引用本文： | 焦清局,刘太岗,郑小琪,连爱娥,黄继风.拟南芥花药基因的共表达分析[J].生物信息学,2010,8(4):350-355. |
| 作者姓名： | 焦清局 刘太岗 郑小琪 连爱娥 黄继风 |
| 作者单位： | 1. 上海师范大学计算机科学与技术系,上海,200234 2. 大连理工大学数学科学学院,辽宁,大连,116024 3. 上海师范大学数理学院,上海,200234 |
| 基金项目： | 上海市教育委员会教育科学研究资助项目 |
| 摘 要： | 运用图论中最大团算法,对ATTED-Ⅱ数据库中提供的拟南芥共表达数据进行分析,为进一步研究基因功能提供了较为可靠的数据。文中提出的算法首先根据芯片数据鉴定拟南芥花药基因,然后以ATTED-Ⅱ数据库为基础构建每一个花药基因的共表达网络,最后利用最大团算法从共表达网络中挖掘共表达数据。基于这种方法,系统地分析了每一个拟南芥花药基因的共表达情况,有助于拟南芥花药发育分子机理和基因转录调控的深入研究。实验验证这种方法对拟南芥花药共表达基因的提取十分有效。 |
| 关 键 词： | 拟南芥 花药 共表达 最大团 ATTED-Ⅱ数据库 |
Analyse Gene Co-expression in Arabidopsis Anther |
|
| JIAO Qing-ju,LIU Tai-gang,ZHENG Xiao-qi,LIAN Ai-e,HUANG Ji-feng.Analyse Gene Co-expression in Arabidopsis Anther[J].China Journal of Bioinformation,2010,8(4):350-355. | |
| Authors: | JIAO Qing-ju LIU Tai-gang ZHENG Xiao-qi LIAN Ai-e HUANG Ji-feng |
| Institution: | 1.Department of computer Science and Technology,Shanghai Normal University,Shanghai 200234,China;2.School of Mathematical,Dalian University of Technology,Dalian 116023,China;3.Department of Mathematics,Shanghai Normal University,Shanghai 200234,China) |
| Abstract: | |
| Keywords: | Arabidopsis anther co-expression Maximum-clique ATTED-Ⅱ-database |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ | |