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米根霉富马酸酶三维结构的同源建模与分析
引用本文:张昆,黄和,刘宁,高振,金明杰,韦萍.米根霉富马酸酶三维结构的同源建模与分析[J].生物信息学,2007,5(3):97-101.
作者姓名:张昆  黄和  刘宁  高振  金明杰  韦萍
作者单位:南京工业大学,制药与生命科学学院,南京,210009
基金项目:江苏省自然科学基金;国家自然科学基金;中国石油化工总公司资助项目
摘    要:利用Modeller7v7软件对米根霉(Rhizopus oryzoe)富马酸酶(fumarase)进行了三级结构的同源建模并对结果的空间和能量上的合理性进行了验证,进一步对酶的结构域和催化活性位点进行了研究。结果表明:富马酸酶由三个结构域组成,中心区域为一个由五个几乎平行的α螺旋组成的独特的束型结构,其催化活性位点是由三个亚基上的氨基酸相互靠近共同组成的。为以后有针对性的进行富马酸酶的定点突变提高富马酸产量提供分子水平上的理论指导。

关 键 词:富马酸酶  米根霉  结构  同源建模  催化活性位点
文章编号:1672-5565(2007)-03-97-05
修稿时间:2006-08-122006-10-19

Homology three-dimensional structure modeling of fumarase from Rhizopus oryzae and its analysis
ZHANG Kun,HUANG He,LIU Ning,GAO Zhen,JIN Ming-jie,WEI Ping.Homology three-dimensional structure modeling of fumarase from Rhizopus oryzae and its analysis[J].China Journal of Bioinformation,2007,5(3):97-101.
Authors:ZHANG Kun  HUANG He  LIU Ning  GAO Zhen  JIN Ming-jie  WEI Ping
Institution:Nanjing University of Technology,College of Pharmacy and Life Science,Nanjing 210009,Jiangsu Prwince,China
Abstract:
Keywords:fumarase  Rhizopus oryzae  structure  homology modeling  actlve site
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