| 基于DNA弯曲度的H2A.Z核小体定位与修饰研究 |
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| 引用本文： | 单增辉,丰继华,陈攀峰,魏恨恨,胡焕.基于DNA弯曲度的H2A.Z核小体定位与修饰研究[J].生物信息学,2015,13(1):13-17. |
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| 作者姓名： | 单增辉 丰继华 陈攀峰 魏恨恨 胡焕 |
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| 作者单位： | 云南民族大学电气信息工程学院,昆明 650500,云南民族大学电气信息工程学院,昆明 650500,云南民族大学电气信息工程学院,昆明 650500,云南民族大学电气信息工程学院,昆明 650500,云南民族大学电气信息工程学院,昆明 650500 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31160234)；云南省应用基础研究计划项目(2011FB082)。 |
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| 摘 要： | 在真核生物染色质中,H2A.Z是高度保守的组蛋白变异体,与转录调控、基因组的稳定性密切相关。为了探讨组蛋白修饰、DNA弯曲度与H2A.Z核小体定位三者之间的关联,在得到实验所测的相关数据后,利用MINE算法并结合皮尔逊相关系数在酵母全基因组的转录起始位点周围探讨了三者间的线性与非线性关系。其中MIC算法可以定量的得出数据之间关联度大小的值,用于衡量数据之间是否存在着关联,而皮尔逊相关系数则用于检查是否为线性关联。结果除了发现大部分组蛋白修饰种类和核小体定位之间存在着线性关联外,还探测到有两种组蛋白修饰数据(H4ac修饰与GCN4修饰)和核小体定位数据之间存在着以往未发现的非线性关系(大致呈正余弦函数),并从数据的生物背景(组蛋白修饰与核小体位置)上探讨了出现非线性现象的原因。
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| 关 键 词： | 转录起始位点(TSS) 组蛋白变异体 H2A.Z 修饰 核小体 |
| 收稿时间： | 2014/9/16 0:00:00 |
Based on the DNA bending H2A. Z nucleosome positioning and modification research |
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| SHAN Zenghui,FENG Jihu,CHEN Panfeng,WEI Henhen and HU Huan.Based on the DNA bending H2A. Z nucleosome positioning and modification research[J].China Journal of Bioinformation,2015,13(1):13-17. |
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| Authors: | SHAN Zenghui FENG Jihu CHEN Panfeng WEI Henhen and HU Huan |
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| Institution: | School of Electrical and Information Technology, Yunnan University of Nationalities, Kunming 650500,China,School of Electrical and Information Technology, Yunnan University of Nationalities, Kunming 650500,China,School of Electrical and Information Technology, Yunnan University of Nationalities, Kunming 650500,China,School of Electrical and Information Technology, Yunnan University of Nationalities, Kunming 650500,China and School of Electrical and Information Technology, Yunnan University of Nationalities, Kunming 650500,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | TSS Histone variants H2A Z Modify Nucleosome |
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