| 大鼠尿激酶SYBR Green Ⅰ real time RT—PCR引物的设计 |
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| 引用本文： | 田永红,熊锦文,丁晓芳,李红钢,黄东晖,熊承良.大鼠尿激酶SYBR Green Ⅰ real time RT—PCR引物的设计[J].生物信息学,2007,5(2):53-57. |
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| 作者姓名： | 田永红 熊锦文 丁晓芳 李红钢 黄东晖 熊承良 |
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| 作者单位： | 华中科技大学同济医学院计划生育研究所,生殖医学中心,武汉430030 |
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| 基金项目： | 国家“十五”科技攻关项目（No.2004BA720A33-1） |
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| 摘 要： | 设计用于SYBR Green Ⅰ法实时定量逆转录多聚酶链反应（QRT—PCR）检测大鼠尿激酶型纤溶酶原激活因子（uPA）mRNA的引物。从基因库获取靶基因及相关序列，充分收集和分析相关生物信息学数据，应用Oligo 6．22设计出一对长度为21bp的引物，其GC含量为52．4％；上下游引物3’最稳定二聚体和及发夹结构的能量分别为-1．5、-0．40kcal／mol和-3．5、-0．90kcal／mol，引物间最稳定二聚体为-3．1kcal／mol。5’端和中间AG值较高，高于3’端AG；引发效率分别455和403。实验证明，该引物能够高效、特异地实现对靶序列的检测，适用于SYBR GreenⅠ法实时定量检测（uPA）mRNA。
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| 关 键 词： | 引物设计 生物信息学 软件 |
| 文章编号： | 1672-5565（2007）-02-53-05 |
| 修稿时间： | 2005-05-232006-06-20 |
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