| 一种新的基于两序列比对的ncRNA基因识别模型 |
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| 引用本文： | 管乃洋,骆志刚,严繁妹,王金华. 一种新的基于两序列比对的ncRNA基因识别模型[J]. 生物信息学, 2007, 5(3): 121-124 |
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| 作者姓名： | 管乃洋 骆志刚 严繁妹 王金华 |
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| 作者单位： | 国防科技大学,计算机学院,湖南,长沙,410073 |
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| 基金项目： | 湖南省自然科学基金;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 利用上下文相关隐Markov模型建立ncRNA基因基本二级结构模型,从两序列比对结果中提取序列相似性信息,并把该信息引入基本的上下文相关Markov模型中,从而构建出新的ncRNA基因识别模型。
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| 关 键 词： | 生物信息学 非编码RNA 隐Markov模型 基因识别 |
| 文章编号： | 1672-5565（2007）-03-121-04 |
| 修稿时间： | 2006-08-12 |
A novel ncRNA gene finding model based on pair-wise alignment |
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| GUAN Nai-yang,LUO Zhi-gang,YAN Fan-mei,WANG Jin-hua. A novel ncRNA gene finding model based on pair-wise alignment[J]. Chinese Journal of Bioinformatics, 2007, 5(3): 121-124 |
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| Authors: | GUAN Nai-yang LUO Zhi-gang YAN Fan-mei WANG Jin-hua |
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| Affiliation: | National Laborutory for Parullel and Distributed Processing,NUDT ,Changsha 410073,China |
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| Abstract: | This paper uses context-sensitive hidden markov for basic ncRNA secondary structure,and distills similarity information from result of pair-wise alignment of two sequences that is close in evolutionary distance.Then we introduce the information into the basic secondary structure model and get the novel ncRNA gene finding model consequently. |
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| Keywords: | Bioinformatic ncRNA HMM GeneFinding |
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