本体:生物医学大数据与精准医学研究的基础 |
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引用本文: | HE Yongqun,余红,杨啸林,邵晨,周伟,朱彦,王海河,刘清平,谢江安,ZHENG Jie,朱伟民.本体:生物医学大数据与精准医学研究的基础[J].生物信息学,2018,16(1):7-14. |
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作者姓名: | HE Yongqun 余红 杨啸林 邵晨 周伟 朱彦 王海河 刘清平 谢江安 ZHENG Jie 朱伟民 |
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作者单位: | 中国医学科学院基础医学研究所;University |
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基金项目: | 美国NIH LINCS (U54HL127624)eDSR课题;贵阳市科技计划筑科合同(20151001 社78号, 20161001号);北京市自然科学基金资助项目(7174328);国家重点研发计划资助(2017YFC0908404);及国际科技合作专项(S2014ZR0005). |
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摘 要: | 在最近兴起的生物医学大数据和精准医学研究中,本体正发挥着不可替代的作用。但一大部分人对本体的定义、类型与应用比较混淆。这篇综述对这些问题进行了回答。具体而言,本体使用人和计算机都可以理解的术语及关系集来表述各种实体/概念以及它们之间关系。根据本体的作用,本体可分为三类:具有多关系模型的增强版控制术语集,反映某知识域的本体知识系统,和对元数据在语义上的约束与标准化的元数据本体。基于这些作用,本体被广泛地应用于生物医学数据的标准化、整合、检索与分析,已经知识的挖掘。当代本体学的研究发展迅速,我国刚刚起步,机遇与挑战并存。广泛地开展国内与国际有关本体的合作研究,将促进国内生物医学本体领域研究水平的整体提升,提高生物与临床科研大数据整合与精准医学研究的能力。
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关 键 词: | 可控词表 本体 基因本体 生物医学大数据 精准医学 本体中国 |
收稿时间: | 2017/10/29 0:00:00 |
修稿时间: | 2017/12/15 0:00:00 |
Ontology:Foundation of biomedical big data and precision medicine research |
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Abstract: | |
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Keywords: | Controlled terminology Ontology Gene ontology Biomedical big data Precision medicine Onto-China |
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