| 生物序列比对算法的研究现状 |
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| 引用本文： | 文凤春,王邦菊,肖枝洪.生物序列比对算法的研究现状[J].生物信息学,2010,8(1):64-67. |
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| 作者姓名： | 文凤春 王邦菊 肖枝洪 |
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| 作者单位： | 华中农业大学理学院,湖北,武汉,430073 |
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| 基金项目： | 华中农业大学学科研究交叉基金 |
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| 摘 要： | 序列比对是生物信息学研究的一个重要工具,它在序列拼接、蛋白质结构预测、蛋白质结构功能分析、系统进化分析、数据库检索以及引物设计等问题的研究中被广泛使用。本文详细介绍了在生物信息学中常用的一些序列比对算法,比较了这些算法所需的计算复杂度,优缺点,讨论了各自的使用范围,并指出今后序列比对研究的发展方向。
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| 关 键 词： | 生物信息学 序列比对 算法 PCGR点 |
Study on biological sequence alignment algorithms |
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| WEN Feng-chun,WANG Bang-ju,XIAO Zhi-hong.Study on biological sequence alignment algorithms[J].China Journal of Bioinformation,2010,8(1):64-67. |
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| Authors: | WEN Feng-chun WANG Bang-ju XIAO Zhi-hong |
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| Institution: | WEN Feng-chun,WANG Bang-ju,XIAO Zhi-hong (School of science Huazhong Agricultural University,Wuhan 430073,China) |
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| Abstract: | Sequence alignment is an important method in bioinformatics.It is widely used in sequence splicing,protein structure prediction,protein structure function analysis,phylogenetic analysis,database retrieval and primer design.This paper introduces commonly sequence alignment algorithms at present,compare the computational complexity of these algorithms,advantage,disadvantage and applicable fields.Finally we pointed out problems of sequence alignment and study direction. |
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| Keywords: | Bioinformatics Sequence Alignment Algorithm PCGR Point |
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