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两种模式生物核小体定位比较研究
引用本文:卢英,丰继华,单秋甫,陈攀峰,单增辉.两种模式生物核小体定位比较研究[J].生物信息学,2014,12(3):162-166.
作者姓名:卢英  丰继华  单秋甫  陈攀峰  单增辉
作者单位:云南民族大学电气信息工程学院,云南 昆明 650500;云南民族大学电气信息工程学院,云南 昆明 650500;云南民族大学电气信息工程学院,云南 昆明 650500;云南民族大学电气信息工程学院,云南 昆明 650500;云南民族大学电气信息工程学院,云南 昆明 650500
基金项目:国家自然科学基金资助项目(31160234);云南省应用基础研究计划项目(2011FB082);省高校重点实验室开放基金(MWK201104)资助。
摘    要:在对两种模式生物酵母与果蝇胚胎期核小体定位进行研究时,发现不同物种间以及同一物种中不同表达模式基因上的核小体分布呈现出差显著异性。在总体上,转录起始位点附近的酵母核小体NFR区域比果蝇的NFR短。经基因中心对齐后,酵母与果蝇胚胎期沉默型基因的核小体缺失区域的两个边界中间处共同呈现了一个明确有着均匀间隔的核小体数n,且随着基因长度L的变长其周期性特性逐渐变模糊,但果蝇的图谱表现的更为复杂。结果表明,从单细胞酵母生物到多细胞果蝇生物间基因组的进化过程中,核小体组织的演化既有变异性,也具有保守性。

关 键 词:酵母  果蝇胚胎期  核小体定位  核小体缺失区域(NFR)
收稿时间:1/7/2014 12:00:00 AM
修稿时间:2014/4/29 0:00:00

A comparative study of nucleosome positioning pattern in two model organisms
LU Ying,FENG Jihu,SHAN Qiufu,CHEN Panfeng and SHAN Zenhui.A comparative study of nucleosome positioning pattern in two model organisms[J].China Journal of Bioinformation,2014,12(3):162-166.
Authors:LU Ying  FENG Jihu  SHAN Qiufu  CHEN Panfeng and SHAN Zenhui
Institution:School of electrical and information technology, Yunnan University of Nationalities,Kunming 650500,China;School of electrical and information technology, Yunnan University of Nationalities,Kunming 650500,China;School of electrical and information technology, Yunnan University of Nationalities,Kunming 650500,China;School of electrical and information technology, Yunnan University of Nationalities,Kunming 650500,China;School of electrical and information technology, Yunnan University of Nationalities,Kunming 650500,China
Abstract:
Keywords:Yeast  Drosophila embryo  Nucleosome positioning  Nucleosome free regions
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